RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264346.11

HERC6-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 6, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC6, Length 3,779 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6-201ENST00000264346 GATA4P43694 442 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 C2orf83Q53S99 150 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 Q5PR19 223 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 SPOCK3Q9BQ16 436 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 CORTO00230 105 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 NDUFS7O75251 213 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 NPPCP23582 126 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 LCN12Q6JVE5 192 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 C5orf17Q8NAS9 161 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 OR2T8A6NH00 312 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 HIGD1CA8MV81 97 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 ISLRO14498 428 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 THBDP07204 575 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 TMEM242Q9NWH2 141 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 C1RLQ9NZP8 487 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 K7ENP7 123 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 M0QZK8 103 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 GGCTO75223 188 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 PSG1P11464 419 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 STPG4Q8N801 248 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 Q9H3A6 140 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 SSX8Q7RTT4 187 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 AP1S3Q96PC3 154 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 MIEN1Q9BRT3 115 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 C19orf24Q9BVV8 132 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa10.15□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 CEACAM4O75871 244 aa10.15□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 LHBP01229 141 aa10.15□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 GPR183P32249 361 aa10.15□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 MFAP4P55083 255 aa10.15□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 WFDC3Q8IUB2 231 aa10.15□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 RITA1Q96K30 269 aa10.15□□□□□ -0.78
HERC6-201ENST00000264346 ADAMTS20P59510 1910 aa10.15□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 PMS2P5A8MQ11 134 aa10.15□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 SNAI2O43623 268 aa10.15□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 HLA-DQA1P01909 254 aa10.15□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa10.15□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 MAS1LP35410 378 aa10.15□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa10.15□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 SMIM15Q7Z3B0 74 aa10.15□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 UFC1Q9Y3C8 167 aa10.15□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 E7EUB6 86 aa10.14□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 S100A4P26447 101 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 SIGLEC9Q9Y336 463 aa10.14□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 RIPPLY3P57055 190 aa10.14□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 IGFL4Q6B9Z1 124 aa10.14□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 Q6ZWC4 215 aa10.14□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 TP73-AS1Q9UF72 201 aa10.14□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 ABCA12Q86UK0 2595 aa10.14□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 CCL25O15444 150 aa10.14□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 NBR2O15453 112 aa10.14□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 FAM106CPP0CH98 169 aa10.14□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 A0A1W2PRE2 83 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 A1L4Q6 167 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 GGTLC3B5MD39 225 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 GUSBP1Q15486 140 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 EPG5Q9HCE0 2579 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 MT-ND6P03923 174 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 TMEM155Q4W5P6 130 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 FBXL7Q9UJT9 491 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 EPDR1Q9UM22 224 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 M0R3E3 92 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 MORN5Q5VZ52 161 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 TMEM219Q86XT9 240 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 OR8A1Q8NGG7 326 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 OR5AL1P0C617 328 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 PF4V1P10720 104 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 OR5AN1Q8NGI8 311 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 ATP5J2P56134 94 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 AARDQ4LEZ3 155 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 ARPC1AQ92747 370 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 C21orf62Q9NYP8 219 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 PMCHL1Q16048 86 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 TEX45Q8NA69 505 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 Q8NA96 180 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 NUDT10Q8NFP7 164 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 NUDT11Q96G61 164 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 PMCHL2Q9BQD1 86 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 PAFAH1B2P68402 229 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 GPR82Q96P67 336 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 AKAP13Q12802 2813 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC6-201ENST00000264346 SHISA9B4DS77 424 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.2 ms