RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 CECR9P0C854 216 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 PMS2P5A8MQ11 134 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 SMKR1H3BMG3 65 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 VGLL1Q99990 258 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 V9GYV3 84 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 CYYR1Q96J86 154 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 LINC00479Q96M42 142 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 SH2D1AO60880 128 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 GAGE2AQ6NT46 116 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 DPM3Q9P2X0 92 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 ANAPC10Q9UM13 185 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 CD7P09564 240 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 DUX5Q96PT3 197 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 IGKV1D-33P01593 117 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 IGKV1-33P01594 117 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 LGALS9BQ3B8N2 356 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 LGALS9CQ6DKI2 356 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 FREM3P0C091 2139 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 DOCK4Q8N1I0 1966 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 TRAV3A0A0B4J244 114 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 TFF1P04155 84 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 CELA3AP09093 270 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 SLC25A45Q8N413 288 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 SLC25A20O43772 301 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 FCN3O75636 299 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 TRGV3P03979 118 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 PDLIM4P50479 330 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 PAX9P55771 341 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 HAPLN4Q86UW8 402 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 ARMS2P0C7Q2 107 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 SMIM20Q8N5G0 67 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 ZNF581Q9P0T4 197 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 C9orf172C9J069 976 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 SIVA1O15304 175 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 SAP30O75446 220 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 CLEC19AQ6UXS0 136 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 RCHY1Q96PM5 261 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 ARID2Q68CP9 1835 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 PF4P02776 101 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 RPL15P61313 204 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 ZNF114Q8NC26 417 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 NABP1Q96AH0 204 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 TIAF1O95411 115 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 TRGV9Q99603 122 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 ZNF492Q9P255 531 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 IL18BPO95998 194 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 CT83Q5H943 113 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 CEND1Q8N111 149 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 C5orf63A6NC05 138 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 CELA3BP08861 270 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 Q86TA4 180 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 FNDC10F2Z333 226 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 TRACP01848 142 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 CCL3L1P16619 93 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 ATP5J2P56134 94 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa13.15□□□□□ -0.3
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CTIF-201ENST00000256413 FGFBP3Q8TAT2 258 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 PRR19A6NJB7 356 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 ICE1Q9Y2F5 2266 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 BOD1L2Q8IYS8 172 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 GATD1Q8NB37 220 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 K7ERJ3 54 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 VWC2Q2TAL6 325 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 DUX3Q96PT4 197 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 SVILO95425 2214 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 TAL2Q16559 108 aa13.15□□□□□ -0.31
CTIF-201ENST00000256413 AMTNQ6UX39 209 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-201ENST00000256413 SPACA3Q8IXA5 215 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-201ENST00000256413 CRPP02741 224 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-201ENST00000256413 TCF15Q12870 199 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-201ENST00000256413 TMEM42Q69YG0 159 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-201ENST00000256413 OVOL2Q9BRP0 275 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-201ENST00000256413 LINC00473A8K010 186 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-201ENST00000256413 PMVKQ15126 192 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-201ENST00000256413 C10orf55Q5SWW7 151 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-201ENST00000256413 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-201ENST00000256413 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CTIF-201ENST00000256413 PATE3B3GLJ2 98 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-201ENST00000256413 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CTIF-201ENST00000256413 GLMPQ8WWB7 406 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-201ENST00000256413 PYGO2Q9BRQ0 406 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-201ENST00000256413 NBR2O15453 112 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-201ENST00000256413 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
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