RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637015.1

ARID1B-223, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene ARID1B, Length 5,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-223	ENST00000637015	ERG28	Q9UKR5	140 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	ITGB1BP1	O14713	200 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	PSG1	P11464	419 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	IFITM2	Q01629	132 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015		H0YJW9	148 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015		J3QRE1	110 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	MLNR	O43193	412 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	ERCC8	Q13216	396 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	SS18	Q15532	418 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015		A0A0G2JNJ9	132 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015		A8MWV9	139 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015		Q9UFV3	132 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	C1QTNF9	P0C862	333 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	IGHV4-39	P01824	125 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF876P	Q49A33	203 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-223	ENST00000637015	TCRA	P04437	139 aa		10.15	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	OCC1	Q8TAD7	63 aa		10.15	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		10.15	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	GAFA1	Q96PS6	74 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	ARID1A	O14497	2285 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	FGF16	O43320	207 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	FOXL1	Q12952	345 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	PDE6H	Q13956	83 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	LCN12	Q6JVE5	192 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015		Q6ZS49	121 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	RHOD	O00212	210 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	PRTN3	P24158	256 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015		E9PQ18	207 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015		H3BUT2	72 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	GZMB	P10144	247 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	DNAJC13	O75165	2243 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	SNAI2	O43623	268 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015		J3QLI3	93 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	PAX4	O43316	350 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	PSG3	Q16557	428 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	CD177	Q8N6Q3	437 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	TMEM219	Q86XT9	240 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	CD55	P08174	381 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	NMS	Q5H8A3	153 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	LEPROT	O15243	131 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	NDUFB8	O95169	186 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	DERL1	Q9BUN8	251 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	APC2	O95996	2303 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	IGKV1D-12	P01611	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	EVI2A	P22794	236 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015		A0A0A6YYD4	124 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	RPRML	Q8N4K4	120 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	RMI2	Q96E14	147 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	PATJ	Q8NI35	1801 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	EREG	O14944	169 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	UBE2E1	P51965	193 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ARID1B-223	ENST00000637015	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79

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