RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 SVEP1Q4LDE5 3571 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 H3BTX0 84 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 PMCHP20382 165 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 PRR27Q6MZM9 219 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 SPACA3Q8IXA5 215 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 FAM19A2Q8N3H0 131 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 BLNKQ8WV28 456 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF253O75346 499 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 APCSP02743 223 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 CTRLP40313 264 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 KRTDAPP60985 99 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 TNXAQ16473 311 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 TBR1Q16650 682 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 ASCL5Q7RTU5 278 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 GRAMD2BQ96HH9 432 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 EPDR1Q9UM22 224 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 M0R143 59 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 FAM87AP0C7U9 286 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 MC5RP33032 325 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 AMTP48728 403 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM116Q8NCL8 245 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 TRGV9Q99603 122 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 DYNLRB1Q9NP97 96 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 KLF12Q9Y4X4 402 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf170-201ENST00000623052 MIEN1Q9BRT3 115 aa10.65□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 MLST8Q9BVC4 326 aa10.65□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.65□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 SIGLEC9Q9Y336 463 aa10.65□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 POLEQ07864 2286 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 LGALS7P47929 136 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 COX19Q49B96 90 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 TEX45Q8NA69 505 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM68Q96MH6 324 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1B0GXF2 115 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 TCAPO15273 167 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 HIGD1CA8MV81 97 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 IGFBPL1Q8WX77 278 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 PERPQ96FX8 193 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 VAMP8Q9BV40 100 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 PGPA6NDG6 321 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 DIRC3C9JPN6 131 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 SIAH2O43255 324 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 C3orf79P0CE67 100 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 RPH3ALQ9UNE2 315 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 A6NNC1 897 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 FBLN7Q53RD9 439 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 GTSF1Q8WW33 167 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF586Q9NXT0 402 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 RASL11AQ6T310 242 aa10.62□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 OVOL3O00110 214 aa10.62□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 LTAP01374 205 aa10.62□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 NBEAP1P0C6P0 100 aa10.62□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 PAX2Q02962 417 aa10.62□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 TCF24Q7RTU0 167 aa10.62□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 PRSS22Q9GZN4 317 aa10.62□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 NBASA2RRP1 2371 aa10.62□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 C19orf71A6NCJ1 209 aa10.62□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 CD24P25063 80 aa10.62□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 PLP1P60201 277 aa10.62□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 FBXL15Q9H469 300 aa10.62□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 OR2J3O76001 311 aa10.61□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 IGLC1P0CG04 106 aa10.61□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 GRNP28799 593 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 CASP6P55212 293 aa10.61□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 Q9H3A6 140 aa10.61□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 LY6LH3BQJ8 138 aa10.61□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 RPL19P84098 196 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 MAJINQ3KP22 176 aa10.61□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 ETFRF1Q6IPR1 90 aa10.61□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 SPATA12Q7Z6I5 190 aa10.61□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 PPP1R27Q86WC6 154 aa10.61□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF785A8K8V0 405 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 I3L2K1 104 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 HYPMO75409 117 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 TOMM40O96008 361 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 TCRAP04437 139 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 COX7A1P24310 79 aa10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms