RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF506Q5JVG8 444 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 CBLN2Q8IUK8 224 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10P1Q8NGE3 313 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 OR9G4Q8NGQ1 327 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 OR52E5Q8NH55 327 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 CCL13Q99616 98 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 AGMATQ9BSE5 352 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 RSG1Q9BU20 258 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC35B3Q9H1N7 401 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 IFI27L2Q9H2X8 130 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 DYNLRB1Q9NP97 96 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS10P5Q9NQ39 176 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 SMCO4Q9NRQ5 59 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 CTSZQ9UBR2 303 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 CLN8Q9UBY8 286 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC00312Q9Y6C7 94 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 PRR14LQ5THK1 2151 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 ARID1AO14497 2285 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PPV4 95 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 DPRXA6NFQ7 191 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 C9JQL5 133 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 HRASP01112 189 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 IFNA17P01571 189 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 APOA2P02652 100 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 GYPAP02724 150 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 CGB3P0DN86 165 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 CGB7P0DN87 165 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 FGF7P21781 194 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 NFYBP25208 207 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 PAX6P26367 422 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 GNG10P50151 68 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2B8PP59922 312 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 HILS1P60008 231 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 SPCS3P61009 180 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 GNB2P62879 340 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 CCL8P80075 99 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 RTL8BQ17RB0 113 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 AKIRIN2Q53H80 203 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 KHDC3LQ587J8 217 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL39P5Q59GN2 51 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 SOHLH1Q5JUK2 328 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM201AQ5SY85 155 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 NCMAPQ5T1S8 102 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 AVPI1Q5T686 147 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 LEMD1Q68G75 181 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAM5Q6NVV9 412 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF429Q86V71 674 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 IQCF2Q8IXL9 164 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 LYG1Q8N1E2 194 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM216BQ8N7L0 139 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF709Q8N972 641 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 DEFB108BQ8NET1 73 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 CLDND2Q8NHS1 167 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 RXFP4Q8TDU9 374 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 SFT2D1Q8WV19 159 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 MBD3L1Q8WWY6 194 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB1CQ92928 201 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 OR4C12Q96R67 309 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 P2RX4Q99571 388 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 ENY2Q9NPA8 101 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNIP2Q9NS61 270 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM106BQ9NUM4 274 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 CACNA1DQ01668 2161 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 COL6A6A6NMZ7 2263 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 URB1O60287 2271 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 C7orf77A4D0Y5 90 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFP92A6NM28 416 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 SHISA9B4DS77 424 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC31A2O15432 143 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFB3O43676 98 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFA2O43678 99 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 MPDU1O75352 247 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 IFNA10P01566 189 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV3-7P01780 117 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 ARG1P05089 322 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 SRP19P09132 144 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 CFC1BP0CG36 223 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 CFC1P0CG37 223 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 OR13C7P0DN81 318 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 BCL2P10415 239 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 IL3RAP26951 378 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 CA7P43166 264 aa3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms