RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF7	Q9UBF6	113 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	EPDR1	Q9UM22	224 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF785	A8K8V0	405 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	HIGD1C	A8MV81	97 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746		E7EUB6	86 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	TAX1BP3	O14907	124 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	HSBP1	O75506	76 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	FCN3	O75636	299 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	LTA	P01374	205 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	IGLV2-23	P01705	113 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	HLA-DRB1	P01911	266 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	GP9	P14770	177 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	TNFSF4	P23510	183 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	GNG5	P63218	68 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	HBB	P68871	147 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	PAX2	Q02962	417 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	LPAL2	Q16609	132 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746		Q56UQ5	140 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746		Q6ZVH6	145 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	SSX8	Q7RTT4	187 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00311	Q8N616	119 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	GATD1	Q8NB37	220 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	GTSF1	Q8WW33	167 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	NPIPB3	Q92617	1050 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	CCL13	Q99616	98 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	PROCR	Q9UNN8	238 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	TNC	P24821	2201 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	TECTA	O75443	2155 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	HCFC1	P51610	2035 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	hADV38S2	A0JD32	116 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM231B	A6NCW3	169 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	SPRY3	O43610	288 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	MOS	P00540	346 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV1-46	P01743	117 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	APOA2	P02652	100 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	OR5AL1	P0C617	328 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	PCP4	P48539	62 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	GNG10	P50151	68 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF137P	P52743	207 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	DLX6	P56179	175 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	BPIFB3	P59826	476 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	PLP1	P60201	277 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	FBLN7	Q53RD9	439 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	PET117	Q6UWS5	81 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	TCF24	Q7RTU0	167 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	SARAF	Q96BY9	339 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	GPR82	Q96P67	336 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	TRGV9	Q99603	122 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		3.97	□□□□□ -1.77

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