RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 CGB2Q6NT52 195 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 LINC00596Q86U02 117 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 OR5A2Q8NGI9 324 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 OR2G3Q8NGZ4 309 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 DTD1Q8TEA8 209 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 SLAMF6Q96DU3 332 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 NICN1Q9BSH3 213 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 GABARAPL3Q9BY60 117 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 HRASLSQ9HDD0 168 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 DIABLOQ9NR28 239 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 CXCR6O00574 342 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 SLC31A2O15432 143 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF737O75373 536 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 UPK1BO75841 260 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 IGHV3-48P01763 117 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 RAB3BP20337 219 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 GALR1P47211 349 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 TAS2R31P59538 309 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 CXCL6P80162 114 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 EBI3Q14213 229 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 KIAA0087Q14695 138 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 MMDQ15546 238 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 LTC4SQ16873 150 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 KLHL12Q53G59 568 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 C2orf83Q53S99 150 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 PDZD11Q5EBL8 140 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF684Q5T5D7 378 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 HES5Q5TA89 166 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 EPGNQ6UW88 154 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 IL34Q6ZMJ4 242 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 TEX43Q6ZNM6 134 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC54Q8NEL0 328 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 OR10W1Q8NGF6 305 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 ZFAND1Q8TCF1 268 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 GTSF1Q8WW33 167 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 AP3S1Q92572 193 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 LEAP2Q969E1 77 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 NMNAT3Q96T66 252 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 TEAD3Q99594 435 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 CST11Q9H112 138 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 ARV1Q9H2C2 271 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 ARMC1Q9NVT9 282 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 CMTM6Q9NX76 183 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 TRAV10A0A0B4J240 114 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM238C9JI98 176 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 TNFRSF11BO00300 401 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 DEFB4AO15263 64 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 FABP7O15540 132 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 HPGDSO60760 199 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 SPAG7O75391 227 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 OR2A4O95047 310 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 HAND1O96004 215 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 P01737 135 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 TRGV3P03979 118 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 LIMS3P0CW19 117 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 LIMS4P0CW20 117 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 IL3RAP26951 378 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 G0S2P27469 103 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 ERP29P30040 261 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
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PDE4D-217ENST00000509355 CD164Q04900 197 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 PP632Q6XCG6 107 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 ANGPTL5Q86XS5 388 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 Q8N6K4 173 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 YIPF7Q8N8F6 280 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 UBAC2Q8NBM4 344 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 OR10J6PQ8NGY7 276 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 OR4K13Q8NH42 304 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 OR4A5Q8NH83 315 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 SPACA5Q96QH8 159 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 PLSCR3Q9NRY6 295 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PDE4D-217ENST00000509355 CDC42EP2O14613 210 aa3.02□□□□□ -1.93
PDE4D-217ENST00000509355 BET1O15155 118 aa3.02□□□□□ -1.93
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