RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 HAX1O00165 279 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 CXCL8P10145 99 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 GCHFRP30047 84 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 LEPP41159 167 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 PMAIP1Q13794 54 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 EBI3Q14213 229 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 LGALS9BQ3B8N2 356 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 LGALS9CQ6DKI2 356 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 NABP1Q96AH0 204 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 BMFQ96LC9 184 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 A0A0U1RQV1 116 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 HLA-DRB4P13762 266 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 PCSK4Q6UW60 755 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 PIFOQ8TCI5 191 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 RND1Q92730 232 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 DSCR8Q96T75 97 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 LMO7DNF2Z398 122 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 C16orf97H3BN30 126 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 SPINT2O43291 252 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 CXCL13O43927 109 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 IGKCP01834 107 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 CDSNQ15517 529 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 CST6Q15828 149 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 LINC01590Q5TEZ4 76 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 PCP2Q8IVA1 136 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 MYOZ3Q8TDC0 251 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM158Q8WZ71 300 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 VKORC1Q9BQB6 163 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 C15orf62A8K5M9 175 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 K7EM74 188 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 HLA-DMBP28068 263 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 HES3Q5TGS1 186 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 FSCN3Q9NQT6 498 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 OCIAD1Q9NX40 245 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 SSC5DA1L4H1 1573 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 NCOR1O75376 2440 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 PSMB8P28062 276 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF747Q9BV97 191 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 PILRAQ9UKJ1 303 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 COL4A1P02462 1669 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 C15orf61A6NNL5 157 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 H3BVH4 76 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 K7ESM1 405 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 VMA21Q3ZAQ7 101 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 PMS2CLQ68D20 193 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 DEFB118Q96PH6 123 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 SCO2A0A1W2PP80 73 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 LILRA5A6NI73 299 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 TIMM23O14925 209 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 COX6A1P12074 109 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 MFSD12Q6NUT3 480 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 LINC00311Q8N616 119 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 CACNG5Q9UF02 275 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 LINC00527Q9UJ94 153 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 C5orf63A6NC05 138 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 MFAP2P55001 183 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 FKBP1CQ5VVH2 108 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 SCAMP4Q969E2 229 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 C11orf52Q96A22 123 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 HHLA3Q9XRX5 114 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 SCN3AQ9NY46 2000 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 A0A0A6YYD4 124 aa4.96□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa4.96□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 hADV29S1A0JD25 119 aa4.96□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 CLDN14O95500 239 aa4.96□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 PYYP10082 97 aa4.96□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 Q71RC1 249 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.96□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.61
PDE4D-216ENST00000507116 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 A0A1W2PRU2 124 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 FAM90A10PA6NDY2 464 aa4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms