RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454269.5

HCG18-240, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 2,430 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-240ENST00000454269 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 LMO7DNF2Z398 122 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 K7ERJ3 54 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 IMUPQ9GZP8 106 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 FSCN3Q9NQT6 498 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 NDUFS7O75251 213 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 GNB1P62873 340 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 OVCA2Q8WZ82 227 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 SCN2AQ99250 2005 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 SSR2P43308 183 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 TNP2Q05952 138 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 PSMG4Q5JS54 123 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 FAM90A10PA6NDY2 464 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 C11orf94C9JXX5 98 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 NDUFB2O95178 105 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 TRACP01848 142 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 CD7P09564 240 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 COX7CP15954 63 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 LEPP41159 167 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 ODF3Q96PU9 254 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 C15orf61A6NNL5 157 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 C2CD4DB7Z1M9 353 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 HMGN4O00479 90 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 RTL8BQ17RB0 113 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 Q6P435 159 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 NPIPB3Q92617 1050 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 SCAMP4Q969E2 229 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 C2orf48Q96LS8 159 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 V9GYV3 84 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 A8MWV9 139 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 RENP00797 406 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 UNC119Q13432 240 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 CDSNQ15517 529 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 TREML4Q6UXN2 200 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 FAM57AQ8TBR7 257 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 WFDC5Q8TCV5 224 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 RND1Q92730 232 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 GNG12Q9UBI6 72 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 ATG2BQ96BY7 2078 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 CHEK1O14757 476 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 CST7O76096 145 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 NDUFC2O95298 119 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 GYPBP06028 91 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 HLA-DMBP28068 263 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 C12orf74Q32Q52 190 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 AAED1Q7RTV5 226 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 ZAR1Q86SH2 424 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 BMFQ96LC9 184 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-240ENST00000454269 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-240ENST00000454269 PCSK5Q92824 1860 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-240ENST00000454269 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-240ENST00000454269 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-240ENST00000454269 PRRG2O14669 202 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-240ENST00000454269 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
HCG18-240ENST00000454269 PSMB8P28062 276 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-240ENST00000454269 PLA2G5P39877 138 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-240ENST00000454269 HERV-K104P61576 105 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-240ENST00000454269 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
HCG18-240ENST00000454269 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-240ENST00000454269 PIFOQ8TCI5 191 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-240ENST00000454269 NMNAT3Q96T66 252 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-240ENST00000454269 FAM60AQ9NP50 221 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-240ENST00000454269 FAM186AA6NE01 2351 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-240ENST00000454269 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-240ENST00000454269 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-240ENST00000454269 C16orf97H3BN30 126 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-240ENST00000454269 CXCL13O43927 109 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-240ENST00000454269 NDUFB4O95168 129 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-240ENST00000454269 CLDN14O95500 239 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms