RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366955.7

CENPF-201, Transcript of centromere protein F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPF, Length 10,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-201ENST00000366955 PRSS57Q6UWY2 283 aa3.41□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa3.41□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 LINC00303Q3SY05 128 aa3.41□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa3.41□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 LYZL2Q7Z4W2 148 aa3.41□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 CCL1P22362 96 aa3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 TIRAPP58753 221 aa3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 MTFP1Q9UDX5 166 aa3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 LINC01549A6NIU2 74 aa3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 FAM90A26D6RGX4 464 aa3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 LEPROTL1O95214 131 aa3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 SEC61GP60059 68 aa3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 BAK1Q16611 211 aa3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 CADM3Q8N126 398 aa3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 MEGF9Q9H1U4 602 aa3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 H0YL77 283 aa3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 TYMSP04818 313 aa3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 PLNP26678 52 aa3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 CRYBB2P43320 205 aa3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 C14orf177Q52M58 125 aa3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 RPL39P5Q59GN2 51 aa3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 ZNF880Q6PDB4 577 aa3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 FREM3P0C091 2139 aa3.4□□□□□ -1.86
CENPF-201ENST00000366955 A0A096LPF7 62 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 A0A1W2PP11 408 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 NDUFA3O95167 84 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 GAS1P54826 345 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 MIC13Q5XKP0 118 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 TMEM136Q6ZRR5 245 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 NUPR2A6NF83 97 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 RPL34P49207 117 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 PIP4P1Q86T03 277 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 RIMKLAQ8IXN7 391 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 C1orf159Q96HA4 380 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 PTPRDP23468 1912 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 HELZP42694 1942 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 IGF2P01344 180 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 CRYBB3P26998 211 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 ZFAND6Q6FIF0 208 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 NTF4P34130 210 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 NHLRC3Q5JS37 347 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 AQP3Q92482 292 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 TMEM30AQ9NV96 361 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 ARL14EPLP0DKL9 152 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 FUNDC1Q8IVP5 155 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 OR52E5Q8NH55 327 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 C11orf45Q8TAV5 145 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 NDUFAF3Q9BU61 184 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa3.4□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 E7EQL1 145 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 LY6G6DO95868 133 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 COL8A2P25067 703 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 P2RY4P51582 365 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 GTSF1Q8WW33 167 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 FMC1Q96HJ9 113 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 C18orf15Q96N68 181 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 ICOSQ9Y6W8 199 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 KIAA1671Q9BY89 1806 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 GAGE12JA6NER3 117 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 J3QL48 77 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 CD5LO43866 347 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 PFN1P07737 140 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 GAGE1Q13065 139 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 GAGE4Q13068 117 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 GAGE5Q13069 117 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 GAGE13Q4V321 117 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 NEUROG1Q92886 237 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 IMMP1LQ96LU5 166 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 VPREB3Q9UKI3 123 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 A0A0J9YY99 117 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 YPEL1O60688 119 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 NDUFB4O95168 129 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 EGR4Q05215 589 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 NFE4Q86UQ8 179 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 RNF125Q96EQ8 232 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 YPEL2Q96QA6 119 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 ARID1AO14497 2285 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 TRAV2A0A0B4J234 112 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 NDUFA4O00483 81 aa3.39□□□□□ -1.87
CENPF-201ENST00000366955 TEX43Q6ZNM6 134 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.8 ms