RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345015.4

KCNQ1-203, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KCNQ1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-203ENST00000345015 HAPLN4Q86UW8 402 aa9.16□□□□□ -0.94
KCNQ1-203ENST00000345015 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.16□□□□□ -0.94
KCNQ1-203ENST00000345015 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
KCNQ1-203ENST00000345015 RNF24Q9Y225 148 aa9.16□□□□□ -0.94
KCNQ1-203ENST00000345015 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa9.15□□□□□ -0.94
KCNQ1-203ENST00000345015 PMS2P5A8MQ11 134 aa9.15□□□□□ -0.94
KCNQ1-203ENST00000345015 L7N2F9 121 aa9.15□□□□□ -0.94
KCNQ1-203ENST00000345015 PSG1P11464 419 aa9.15□□□□□ -0.94
KCNQ1-203ENST00000345015 VAMP2P63027 116 aa9.15□□□□□ -0.94
KCNQ1-203ENST00000345015 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.15□□□□□ -0.94
KCNQ1-203ENST00000345015 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
KCNQ1-203ENST00000345015 RNF2Q99496 336 aa9.15□□□□□ -0.94
KCNQ1-203ENST00000345015 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.15□□□□□ -0.94
KCNQ1-203ENST00000345015 RABAC1Q9UI14 185 aa9.15□□□□□ -0.94
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM25EA8MYX2 175 aa9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 OR11H12B2RN74 326 aa9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 RLN2P04090 185 aa9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 IL4P05112 153 aa9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 ASB13Q8WXK3 278 aa9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 RNF125Q96EQ8 232 aa9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 TUBA4BQ9H853 241 aa9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 MGAT4CQ9UBM8 478 aa9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 FBXL17Q9UF56 701 aa9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 BUB3O43684 328 aa9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 SCGB1D2O95969 90 aa9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 PET100P0DJ07 73 aa9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 EDN2P20800 178 aa9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 S100A11P31949 105 aa9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 PLP1P60201 277 aa9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 HBG1P69891 147 aa9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 HBG2P69892 147 aa9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 C11orf87Q6NUJ2 197 aa9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 TCF24Q7RTU0 167 aa9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 BPIFCQ8NFQ6 507 aa9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 CHAC2Q8WUX2 184 aa9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 ST8SIA2Q92186 375 aa9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 H3BP45 60 aa9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 CCSO14618 274 aa9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 CD7P09564 240 aa9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 P2RY1P47900 373 aa9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 SULT1A1P50225 295 aa9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 AKR1C1Q04828 323 aa9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 ATP6V1FQ16864 119 aa9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 TEPPQ6URK8 271 aa9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 C16orf54Q6UWD8 224 aa9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 STX12Q86Y82 276 aa9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 GPR82Q96P67 336 aa9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 ZMAT4Q9H898 229 aa9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 E5RGE8 158 aa9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 SSNA1O43805 119 aa9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 METTL15P1P0C7V9 234 aa9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF90Q03938 601 aa9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 BAXQ07812 192 aa9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 RAB31Q13636 194 aa9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 RAB32Q13637 225 aa9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 VWC2Q2TAL6 325 aa9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 KIR2DL5AQ8N109 375 aa9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 GLMPQ8WWB7 406 aa9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 UBE2CO00762 179 aa9.1□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 MPDU1O75352 247 aa9.1□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 APOHP02749 345 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 CAV2P51636 162 aa9.1□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF546Q86UE3 836 aa9.1□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.1□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 STPG3Q8N7X2 389 aa9.1□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 SPATA25Q9BR10 227 aa9.1□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.1□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 SRD5A3Q9H8P0 318 aa9.1□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 K7EQG2 157 aa9.09□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 GOSR2O14653 212 aa9.09□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 MEOX2P50222 304 aa9.09□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 BCAP31P51572 246 aa9.09□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 H2BFSP57053 126 aa9.09□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 RGS21Q2M5E4 152 aa9.09□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 ODF3L2Q3SX64 289 aa9.09□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa9.09□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 LILRB2Q8N423 598 aa9.09□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.09□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 DCANP1Q8TF63 244 aa9.09□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 NRN1Q9NPD7 142 aa9.09□□□□□ -0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 U3KQK5 164 aa9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.5 ms