RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 OBP2BQ9NPH6 170 aa14.79□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 A0A1W2PRE2 83 aa14.79□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 A6NDN8 102 aa14.79□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 Q6ZR03 302 aa14.79□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 C2orf91Q6ZV80 131 aa14.79□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 VSTM2AQ8TAG5 236 aa14.79□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 SPCS1Q9Y6A9 102 aa14.79□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 K7EQM0 130 aa14.78□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 ICE1Q9Y2F5 2266 aa14.78□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.78□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 AGFG2O95081 481 aa14.78□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 FABP6P51161 128 aa14.78□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 ZNF137PP52743 207 aa14.78□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 C5orf64Q2M2E5 130 aa14.78□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 SGK494Q96LW2 274 aa14.78□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 PTPRBP23467 1997 aa14.78□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 PCNX1Q96RV3 2341 aa14.77□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 TRAV5A0A0B4J249 113 aa14.77□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 PROP1O75360 226 aa14.77□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 C8orf88P0DMB2 117 aa14.77□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 ZNF138P52744 262 aa14.77□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 DEFB109BQ30KR1 87 aa14.77□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 TMEM189A5PLL7 270 aa14.77□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 MYOD1P15172 320 aa14.77□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 PRR33A8MZF0 331 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 HBBP68871 147 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 RTL8BQ17RB0 113 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 MDP1Q86V88 176 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 MBD6Q96DN6 1003 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 LIPFP07098 398 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 CSN3P07498 182 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 FOXE3Q13461 319 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 MRAP2Q96G30 205 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 METRNQ9UJH8 293 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 KALRNO60229 2985 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 CADP27708 2225 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 COX8AP10176 69 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 RAB37Q96AX2 223 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 A0A1W2PPM0 123 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 C15orf61A6NNL5 157 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 VWC2LB2RUY7 222 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 PGLYRP4Q96LB8 373 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 TM4SF5O14894 197 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 ADH4P08319 380 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 KIR3DS1Q14943 382 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 TBC1D28Q2M2D7 210 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 FAM231DQ6ZW35 169 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 PEX7O00628 323 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 PYYP10082 97 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 TCTAP57738 103 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 OR9G1Q8NH87 305 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 BLNKQ8WV28 456 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 SPATA25Q9BR10 227 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 HSPB8Q9UJY1 196 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 MLANAQ16655 118 aa14.73□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 CHEK1O14757 476 aa14.73□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 MORN5Q5VZ52 161 aa14.73□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 OR5AL1P0C617 328 aa14.72□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 J3QR89 54 aa14.72□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 GNG5P63218 68 aa14.72□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 FA2HQ7L5A8 372 aa14.72□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 MTURNQ8N3F0 131 aa14.72□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 ZNF479Q96JC4 524 aa14.72□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 NBASA2RRP1 2371 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 ROS1P08922 2347 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 A0A1B0GXF2 115 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 FABP2P12104 132 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 TMEM178AQ8NBL3 297 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 LEAP2Q969E1 77 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 IGF2RP11717 2491 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-201ENST00000331563 ACP7Q6ZNF0 438 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-201ENST00000331563 C19orf24Q9BVV8 132 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-201ENST00000331563 SPTA1P02549 2419 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-201ENST00000331563 TNCP24821 2201 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-201ENST00000331563 PAXXQ9BUH6 204 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-201ENST00000331563 SLC25A2Q9BXI2 301 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-201ENST00000331563 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-201ENST00000331563 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-201ENST00000331563 C15orf65H3BRN8 121 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-201ENST00000331563 COX7A2P2O60397 106 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-201ENST00000331563 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-201ENST00000331563 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms