RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF492Q9P255 531 aa18.06■□□□□ 0.48
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HOXD1-201ENST00000331462 ORM2P19652 201 aa18.05■□□□□ 0.48
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HOXD1-201ENST00000331462 ASPHD1Q5U4P2 390 aa18.05■□□□□ 0.48
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HOXD1-201ENST00000331462 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
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HOXD1-201ENST00000331462 PRR27Q6MZM9 219 aa18.04■□□□□ 0.48
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HOXD1-201ENST00000331462 IGLC3P0DOY3 106 aa18.03■□□□□ 0.48
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HOXD1-201ENST00000331462 G0S2P27469 103 aa18.02■□□□□ 0.48
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HOXD1-201ENST00000331462 CLEC7AQ9BXN2 247 aa18■□□□□ 0.47
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HOXD1-201ENST00000331462 E7EQL1 145 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXD1-201ENST00000331462 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa17.99■□□□□ 0.47
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HOXD1-201ENST00000331462 C20orf202A1L168 122 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD1-201ENST00000331462 NPIPB6E9PJ23 425 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD1-201ENST00000331462 FAM87AP0C7U9 286 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD1-201ENST00000331462 CNTFRP26992 372 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD1-201ENST00000331462 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
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HOXD1-201ENST00000331462 GFRALQ6UXV0 394 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXD1-201ENST00000331462 TCF24Q7RTU0 167 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXD1-201ENST00000331462 GTSF1Q8WW33 167 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXD1-201ENST00000331462 C2orf70A6NJV1 201 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD1-201ENST00000331462 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD1-201ENST00000331462 BTF3P20290 206 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
HOXD1-201ENST00000331462 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
HOXD1-201ENST00000331462 EBLN2Q6P2I7 272 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD1-201ENST00000331462 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
HOXD1-201ENST00000331462 WNT10AQ9GZT5 417 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD1-201ENST00000331462 MUC6Q6W4X9 2439 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD1-201ENST00000331462 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
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