RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 C7orf71A4D174 169 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 DIRC3C9JPN6 131 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 SLC25A20O43772 301 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 P0C879 139 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 C8orf88P0DMB2 117 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 LIME1Q9H400 295 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 CADP27708 2225 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 E7EQL1 145 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 NABP2Q9BQ15 211 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 A8MWL6 223 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 MYOD1P15172 320 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 CNTFRP26992 372 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 VWC2Q2TAL6 325 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 PRO1933Q9H354 126 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 FUT9Q9Y231 359 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 FAM201AQ5SY85 155 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 OR51M1Q9H341 326 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 H3BRM9 83 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 RAB24Q969Q5 203 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 STAG3L3P0CL85 134 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 MIC13Q5XKP0 118 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 PRELID3AQ96N28 172 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 SHISA9B4DS77 424 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 CACNA1DQ01668 2161 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 TSPAN13O95857 204 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 RIPPLY3P57055 190 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 J3QKU1 62 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 NBR2O15453 112 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 ATRXP46100 2492 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 LEMD1Q68G75 181 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 REG4Q9BYZ8 158 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPN3-201ENST00000262539 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 CD7P09564 240 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 LYNX1P0DP58 116 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 IGKV1-39P01597 117 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 IGKV1D-39P04432 117 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 PAX1P15863 534 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 NPIPB3Q92617 1050 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 H0YJW9 148 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 AWAT1Q58HT5 328 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 RNF114Q9Y508 228 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 GAGE10A6NGK3 116 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 CD24P25063 80 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 ICAM4Q14773 271 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 MUC21Q5SSG8 566 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 PRORYQ9H606 182 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 SFRP2Q96HF1 295 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 TRGV9Q99603 122 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms