RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636280.1

DNM1-222, Transcript of dynamin 1, human

TSL 5

Gene DNM1, Length 2,462 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNM1-222	ENST00000636280	PRR20A	P86496	221 aa		12.67	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		12.67	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		12.67	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	SLC35E1	Q96K37	410 aa		12.67	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		12.67	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	PTPN13	Q12923	2485 aa		12.67	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		12.67	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	FRZB	Q92765	325 aa		12.67	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		12.67	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	MSMB	P08118	114 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	LINC00869	P0C866	280 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	BCL2	P10415	239 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM11	P17152	192 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	OR10J1	P30954	320 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	FXYD3	Q14802	87 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	OR1P1	Q8NH06	330 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	MISP3	Q96FF7	219 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	POLQ	O75417	2590 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280		A0A1W2PPV4	95 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	FAM106CP	P0CH98	169 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	FAM210B	Q96KR6	192 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	CENPE	Q02224	2701 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280		B4DEV8	164 aa		12.65	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	SLC25A16	P16260	332 aa		12.65	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	NPIPB3	Q92617	1050 aa		12.65	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	SSX3	Q99909	188 aa		12.65	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		12.65	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	IGHV1-69	P01742	117 aa		12.65	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	BRS3	P32247	399 aa		12.65	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	PMS2P11	Q13670	270 aa		12.65	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	OR5R1	Q8NH85	324 aa		12.65	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
DNM1-222	ENST00000636280	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		12.64	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	TGOLN2	O43493	480 aa		12.64	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	CRYGC	P07315	174 aa		12.64	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	PLA2G2A	P14555	144 aa		12.64	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		12.64	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280		B4DSR2	109 aa		12.64	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	CX3CL1	P78423	397 aa		12.64	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		12.64	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		12.64	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		12.64	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	IFNA1	P01562	189 aa		12.63	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	RND2	P52198	227 aa		12.63	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		12.63	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		12.63	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	VAX2	Q9UIW0	290 aa		12.63	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280		A0A096LNT2	108 aa		12.63	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	CORT	O00230	105 aa		12.63	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		12.63	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280		Q8N9W7	124 aa		12.63	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		12.63	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		12.63	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		12.63	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280		J3QKU1	62 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	PHOX2A	O14813	284 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	NDP	Q00604	133 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	STAG3L2	P0CL84	134 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	STAG3L3	P0CL85	134 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	RHOB	P62745	196 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	THAP8	Q8NA92	274 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	ARPC1A	Q92747	370 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	ABCA1	O95477	2261 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280		A8MWP6	167 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	CLDN34	H7C241	214 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	MT-CO2	P00403	227 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	C1RL	Q9NZP8	487 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF90	Q03938	601 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	12.6	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	PSMB3	P49720	205 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	FAM78B	Q5VT40	261 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DNM1-222	ENST00000636280	NEU1	Q99519	415 aa		12.6	□□□□□ -0.39

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