RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613864.4

TARDBP-215, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 4

Gene TARDBP, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-215	ENST00000613864	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	DKK2	Q9UBU2	259 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	BUB3	O43684	328 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	IFNA10	P01566	189 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	10.17	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	HLA-DRB4	P13762	266 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	10.17	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	SP6	Q3SY56	376 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	HERC1	Q15751	4861 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	RND2	P52198	227 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	EMP1	P54849	157 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	PIGP	P57054	158 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	FXYD7	P58549	80 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	RNF212	Q495C1	297 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	ZNF709	Q8N972	641 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	YIPF6	Q96EC8	236 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	FAM210B	Q96KR6	192 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	NRN1	Q9NPD7	142 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	IFNA21	P01568	189 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	UCP1	P25874	307 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	RCVRN	P35243	200 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	AKR1C2	P52895	323 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864		Q8WTZ3	238 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-215	ENST00000613864	APOA1	P02647	267 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	PGAM2	P15259	253 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	ELK1	P19419	428 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	OR10J1	P30954	320 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	SPCS3	P61009	180 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	TNP2	Q05952	138 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	C2orf83	Q53S99	150 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	KLK11	Q9UBX7	282 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	TMEM189	A5PLL7	270 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	CDK2AP2	O75956	126 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	IGKV3-20	P01619	116 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	IL4	P05112	153 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	HTR2B	P41595	481 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	OXA1L	Q15070	435 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	OR52E5	Q8NH55	327 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	NPIPB3	Q92617	1050 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	RFNG	Q9Y644	331 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	SOCS3	O14543	225 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	LCE2B	O14633	110 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	CDS2	O95674	445 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	TOMM40	O96008	361 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	CD3D	P04234	171 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	PSG1	P11464	419 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	SLC25A4	P12235	298 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	ENY2	Q9NPA8	101 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	HPGDS	O60760	199 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	RD3L	P0DJH9	198 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	ZNF79	Q15937	498 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	TRIM16L	Q309B1	348 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	GPR146	Q96CH1	333 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	C17orf77	Q96MU5	243 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TARDBP-215	ENST00000613864	SCGB2A1	O75556	95 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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