RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 SEC22AQ96IW7 307 aa6.2□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 TSC22D3Q99576 134 aa6.2□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.2□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 EHFQ9NZC4 300 aa6.2□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 A0A1W2PS18 150 aa6.19□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 HTN3P15516 51 aa6.19□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 DHRS2Q13268 280 aa6.19□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.19□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.19□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.19□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 OR4A16Q8NH70 328 aa6.19□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 BORCS5Q969J3 196 aa6.19□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 FAM210BQ96KR6 192 aa6.19□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 METTL26Q96S19 204 aa6.19□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 NEU1Q99519 415 aa6.19□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 HELTA6NFD8 242 aa6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 H3BMM0 161 aa6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 GPR31O00270 319 aa6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 IGKV1-17P01599 117 aa6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 PMP2P02689 132 aa6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 SDC2P34741 201 aa6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 CBX5P45973 191 aa6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 DEFB1P60022 68 aa6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 GLMPQ8WWB7 406 aa6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 NRG4Q8WWG1 115 aa6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 DKK2Q9UBU2 259 aa6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 COX11Q9Y6N1 276 aa6.18□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 A0A0A6YYH2 397 aa6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 TMEM189A5PLL7 270 aa6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 A6NJ64 397 aa6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 EBAG9O00559 213 aa6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 CLN5O75503 358 aa6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 FXYD7P58549 80 aa6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 MXD1Q05195 221 aa6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 TIGITQ495A1 244 aa6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 TMEM230Q96A57 120 aa6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 IFT46Q9NQC8 304 aa6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 GAGE12BA1L429 117 aa6.16□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.16□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.16□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 IGKV3-20P01619 116 aa6.16□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 HLA-DRB4P13762 266 aa6.16□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 SNCAP37840 140 aa6.16□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 SCAND1P57086 179 aa6.16□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 IDNKQ5T6J7 187 aa6.16□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 C6orf223Q8N319 242 aa6.16□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.16□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 OR4X1Q8NH49 305 aa6.16□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 DIABLOQ9NR28 239 aa6.16□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 RFNGQ9Y644 331 aa6.16□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.16□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.16□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 A0A0B4J293 547 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 IGKV1-5P01602 117 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 P0C879 139 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 IGLC1P0CG04 106 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 PSMB9P28065 219 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 HRH1P35367 487 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 OPRK1P41145 380 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 OXA1LQ15070 435 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 SLC35G3Q8N808 338 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 ZNF709Q8N972 641 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms