RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601471.1

LINC00649-212, long intergenic non-protein coding RNA 649, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00649, Length 538 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00649-212ENST00000601471 C20orf24Q9BUV8 137 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 VSIRQ9H7M9 311 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 NUDT15Q9NV35 164 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 SYNGR2O43760 224 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 SCGB2A1O75556 95 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 MED6O75586 246 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 UPK1BO75841 260 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 YIF1AO95070 293 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 IFNA10P01566 189 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 CRYBB3P26998 211 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 OR10J1P30954 320 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 RND2P52198 227 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 ZNF846Q147U1 533 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 GUCA2BQ16661 112 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 C4orf46Q504U0 113 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 OR52B4Q8NGK2 314 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 ASCL2Q99929 193 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 U3KQK5 164 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 OR11H12B2RN74 326 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 APOHP02749 345 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 CD5P06127 495 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 IFITM3Q01628 133 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 HAGHQ16775 308 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 TIGITQ495A1 244 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 DEFB125Q8N687 156 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 U3KQE9 123 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 TRAV6A0A075B6T7 132 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 OR4C46A6NHA9 309 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 TOMM40O96008 361 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 IAPPP10997 89 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 BMI1P35226 326 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 GAMTQ14353 236 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 LILRB2Q8N423 598 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 ST8SIA2Q92186 375 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 NPIPB3Q92617 1050 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 RCHY1Q96PM5 261 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 CITED4Q96RK1 184 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 WRBO00258 174 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 IFNA21P01568 189 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 IFNA4P05014 189 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 PAX9P55771 341 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 RAB11AP62491 216 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 MZT2BQ6NZ67 158 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 THAP8Q8NA92 274 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 ACY3Q96HD9 319 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 METTL26Q96S19 204 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 SPATA25Q9BR10 227 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 TUBA4BQ9H853 241 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 IL4P05112 153 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 IL5P05113 134 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 PSG1P11464 419 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 NPPCP23582 126 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 TAS2R30P59541 319 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 RPP30P78346 268 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 TCF24Q7RTU0 167 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 Q8WTZ3 238 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 GLMPQ8WWB7 406 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 SLC35E1Q96K37 410 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 SMIM8Q96KF7 97 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 TRGV9Q99603 122 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00649-212ENST00000601471 ZMAT4Q9H898 229 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms