RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597063.6

STRN4-215, Transcript of striatin 4, human

TSL 4

Gene STRN4, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STRN4-215	ENST00000597063	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		13.59	□□□□□ -0.23
STRN4-215	ENST00000597063	TSPAN4	O14817	238 aa		13.58	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	IFNA21	P01568	189 aa		13.58	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	OR10J1	P30954	320 aa		13.58	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	TFPI2	P48307	235 aa		13.58	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	NPIPB3	Q92617	1050 aa		13.58	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		13.58	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	WRB	O00258	174 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	NPPC	P23582	126 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	BMI1	P35226	326 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	ST8SIA2	Q92186	375 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	OR4C46	A6NHA9	309 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	SYNGR2	O43760	224 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	IGKV1-17	P01599	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	TCRB	P04435	133 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	RAB11A	P62491	216 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	TCF24	Q7RTU0	167 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063		Q8WTZ3	238 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	MPTX1	A8MV57	137 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	IGLC1	P0CG04	106 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	METTL26	Q96S19	204 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	SPATA25	Q9BR10	227 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	DFFB	O76075	338 aa		13.54	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	LILRB2	Q8N423	598 aa		13.54	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	SLC35E1	Q96K37	410 aa		13.54	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		13.54	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		13.54	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		13.53	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063		A0A1W2PS18	150 aa		13.53	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	SCGB1D2	O95969	90 aa		13.53	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	PAFAH1B2	P68402	229 aa		13.53	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	ZNF846	Q147U1	533 aa		13.53	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		13.53	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		13.53	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	VSIR	Q9H7M9	311 aa		13.53	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	RETN	Q9HD89	108 aa		13.53	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	NUDT15	Q9NV35	164 aa		13.53	□□□□□ -0.24
STRN4-215	ENST00000597063	ZFP92	A6NM28	416 aa		13.52	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063		H3BP45	60 aa		13.52	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	IL4	P05112	153 aa		13.52	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		13.52	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	RD3L	P0DJH9	198 aa		13.52	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	GAMT	Q14353	236 aa		13.52	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		13.52	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	CITED4	Q96RK1	184 aa		13.52	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		13.52	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		13.52	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	CD5	P06127	495 aa		13.51	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	CRYBB3	P26998	211 aa		13.51	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	ID3	Q02535	119 aa		13.51	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		13.51	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	MITD1	Q8WV92	249 aa		13.51	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		13.51	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	SSSCA1	O60232	199 aa		13.5	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	TOMM40	O96008	361 aa		13.5	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	PSG1	P11464	419 aa		13.5	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	P2RY1	P47900	373 aa		13.5	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		13.5	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		13.5	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		13.5	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		13.5	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		13.5	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	BATF3	Q9NR55	127 aa		13.5	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		13.5	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	RABAC1	Q9UI14	185 aa		13.5	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		13.5	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	FAM25E	A8MYX2	175 aa		13.49	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	CCS	O14618	274 aa		13.49	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
STRN4-215	ENST00000597063	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		13.49	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms