RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.36□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.36□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 SCGB2A1O75556 95 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 IGLC1P0CG04 106 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 ETV6P41212 452 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 RPL5P46777 297 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 UCP3P55916 312 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 FXYD7P58549 80 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 DEFB1P60022 68 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 TSPAN5P62079 268 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 BSXQ3C1V8 233 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 TMEM88Q6PEY1 159 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 NRN1Q9NPD7 142 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 RFNGQ9Y644 331 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 IGKV3-20P01619 116 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 PRSS3P35030 304 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 UBE2NLQ5JXB2 153 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 PDCD10Q9BUL8 212 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CTIF-211ENST00000592658 A0A0G2JRQ6 117 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 TMEM127O75204 238 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 TGFBR1P36897 503 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 AKR1C2P52895 323 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 DHODHQ02127 395 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 OXA1LQ15070 435 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 C6orf223Q8N319 242 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 OR1S2Q8NGQ3 325 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 GPX8Q8TED1 209 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 Q8WTZ3 238 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 TP53RKQ96S44 253 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 BUB3O43684 328 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 IL4P05112 153 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 PI3P19957 117 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 RND2P52198 227 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 PRSS54Q6PEW0 395 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 SAMD12Q8N8I0 201 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 ZNF709Q8N972 641 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 ENY2Q9NPA8 101 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 EPM2AB3EWF7 344 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 INAFM2P0DMQ5 153 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 OR10J1P30954 320 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 RND3P61587 244 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 SLC35B3Q9H1N7 401 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 TMED3Q9Y3Q3 217 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 HMCN2Q8NDA2 5059 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 PIGPP57054 158 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 NEDD8Q15843 81 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 M0QYG6 137 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 NXPH3O95157 252 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 TOMM40O96008 361 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 HBE1P02100 147 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 SLC25A4P12235 298 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 PGAM2P15259 253 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 RCVRNP35243 200 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 HTR2BP41595 481 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP10-2P60368 255 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 DAD1P61803 113 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 TRIM16LQ309B1 348 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 SP6Q3SY56 376 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 GSG1LQ6UXU4 331 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 LHFPL1Q86WI0 220 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 CROCCP3Q8IVE0 287 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 TMEM170AQ8WVE7 144 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 LINC00052Q96N35 136 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 SOCS3O14543 225 aa9.28□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 ATG12O94817 140 aa9.28□□□□□ -0.92
CTIF-211ENST00000592658 RPS19P39019 145 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
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