RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 SMLR1H3BR10 107 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 TNFSF12O43508 249 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 CD5P06127 495 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 CTSGP08311 255 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 SPP1P10451 314 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 TAS2R31P59538 309 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 FGL1Q08830 312 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 SPHARQ15513 63 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 PSG3Q16557 428 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 GUK1Q16774 197 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 HACD4Q5VWC8 232 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 Q6ZR54 194 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 Q6ZRM9 215 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 FAM219AQ8IW50 185 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 AP3S1Q92572 193 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 UFD1Q92890 307 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 OR10C1Q96KK4 312 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 PRRT1Q99946 306 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 S100A14Q9HCY8 104 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 CELA1Q9UNI1 258 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 X6R8D5 127 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 F8W735 103 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 K7EIM0 57 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 HPRT1P00492 218 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 RAB6AP20340 208 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 GNG2P59768 71 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 WT1-ASQ06250 92 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 ARL6IP1Q15041 203 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 CNIH2Q6PI25 160 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 Q8N1X5 172 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 GINS3Q9BRX5 216 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1W2PPQ1 181 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00587B1AMM8 73 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 SULT1C2O00338 296 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 CD74P04233 296 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 FGF2P09038 288 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 C4BPBP20851 252 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 CATR1Q13166 79 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 TRAM1Q15629 374 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 VAMP3Q15836 100 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 POU2AF1Q16633 256 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 CDNFQ49AH0 187 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 C5orf47Q569G3 176 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF773Q6PK81 442 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 ST8SIA2Q92186 375 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 RABAC1Q9UI14 185 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 SMCO3A2RU48 225 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 KNCNA6PVL3 124 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 CTDSPLO15194 276 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00614P0C842 121 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 SEC61GP60059 68 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 ERVK-16P61578 105 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 MSMO1Q15800 293 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 SRRQ9GZT4 340 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 VSIRQ9H7M9 311 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.54□□□□□ -1.36
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