RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.21□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR4A16Q8NH70 328 aa7.21□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.21□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 VCX3BQ9H321 246 aa7.21□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 LYRM9A8MSI8 78 aa7.2□□□□□ -1.26
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CTDNEP1-202ENST00000570380 PSG9Q00887 426 aa7.2□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.2□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.2□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR4X1Q8NH49 305 aa7.2□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 SEC22AQ96IW7 307 aa7.2□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 CNBD2Q96M20 576 aa7.2□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 UPK3BQ9BT76 320 aa7.2□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.2□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 ACOT13Q9NPJ3 140 aa7.2□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 SMIM30A4D0T7 59 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 EREGO14944 169 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 BUB3O43684 328 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 IFNA5P01569 189 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 ATP5G1P05496 136 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 SNCAP37840 140 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 ATP5G3P48201 142 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 HSPA13P48723 471 aa7.19□□□□□ -1.26
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CTDNEP1-202ENST00000570380 HERV-K104P61576 105 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF79Q15937 498 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 ESRGQ1W209 222 aa7.19□□□□□ -1.26
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CTDNEP1-202ENST00000570380 BORCS5Q969J3 196 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 LINC00052Q96N35 136 aa7.19□□□□□ -1.26
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CTDNEP1-202ENST00000570380 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.18□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 CBY3A6NI87 242 aa7.18□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 F6UB75 175 aa7.18□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 M0QYG6 137 aa7.18□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 CORTO00230 105 aa7.18□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGKV1-39P01597 117 aa7.18□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGKV1D-39P04432 117 aa7.18□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 OPRK1P41145 380 aa7.18□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM78BQ5VT40 261 aa7.18□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.18□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR5AP2Q8NGF4 316 aa7.18□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.18□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 DUSP21Q9H596 190 aa7.18□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.18□□□□□ -1.26
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CTDNEP1-202ENST00000570380 RAB26Q9ULW5 256 aa7.18□□□□□ -1.26
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CTDNEP1-202ENST00000570380 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.17□□□□□ -1.26
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CTDNEP1-202ENST00000570380 MYL9P24844 172 aa7.17□□□□□ -1.26
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CTDNEP1-202ENST00000570380 DHRS11Q6UWP2 260 aa7.17□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q8WTZ3 238 aa7.17□□□□□ -1.26
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CTDNEP1-202ENST00000570380 MGLLQ99685 303 aa7.17□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 TPRKBQ9Y3C4 175 aa7.17□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.16□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRAV18A0A075B6X5 111 aa7.16□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 RGS10O43665 173 aa7.16□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 SCGB2A1O75556 95 aa7.16□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGLC1P0CG04 106 aa7.16□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.16□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 AZU1P20160 251 aa7.16□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 RPL5P46777 297 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 AMTNQ6UX39 209 aa7.16□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 CMTM1Q8IZ96 169 aa7.16□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR4C16Q8NGL9 310 aa7.16□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR1S2Q8NGQ3 325 aa7.16□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 FXYD6Q9H0Q3 95 aa7.16□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 EHFQ9NZC4 300 aa7.16□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.16□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.15□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 A0A087WTM6 91 aa7.15□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 A0A0J9YX75 114 aa7.15□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 MEIS3P1A6NDR6 274 aa7.15□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 GPR31O00270 319 aa7.15□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 SOCS3O14543 225 aa7.15□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 IL4P05112 153 aa7.15□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 GCSHP23434 173 aa7.15□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 TSPOP30536 169 aa7.15□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 ID1P41134 155 aa7.15□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 RFX2P48378 723 aa7.15□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 PSMB3P49720 205 aa7.15□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.15□□□□□ -1.26
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