RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566613.1

GDPD3-205, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 3, human

TSL 5

Gene GDPD3, Length 235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GDPD3-205	ENST00000566613	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	WDR31	Q8NA23	367 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	OR51H1	Q8NH63	302 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	PRELID3A	Q96N28	172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613		A8MWL6	223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	MS4A18	H0YCH9	400 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613		J3KT08	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	SPINK4	O60575	86 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	NDUFS7	O75251	213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	ACTL6B	O94805	426 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	MOS	P00540	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	RBP4	P02753	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	CLPS	P04118	112 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	GRP	P07492	148 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	IFITM1	P13164	125 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	SRY	Q05066	204 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	FHL3	Q13643	280 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	NNAT	Q16517	81 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	CEND1	Q8N111	149 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	RPRML	Q8N4K4	120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	PIGC	Q92535	297 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	RND1	Q92730	232 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	SPTSSA	Q969W0	71 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	COQ2	Q96H96	371 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDPD3-205	ENST00000566613	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613		H0YGG7	62 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613		M0R135	149 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	SNCG	O76070	127 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	LINC00271	P0C7V0	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	PRTN3	P24158	256 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	CXCL12	P48061	93 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	INSL3	P51460	131 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	EDDM3B	P56851	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	MFAP5	Q13361	173 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	C10orf128	Q5T292	105 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	PRR22	Q8IZ63	422 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	ZNF799	Q96GE5	643 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GDPD3-205	ENST00000566613		A0A1W2PPI3	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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