RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563951.1

CCDC33-211, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC33, Length 308 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-211ENST00000563951 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 RND2P52198 227 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 TIGITQ495A1 244 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 MITD1Q8WV92 249 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 MARC2Q969Z3 335 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 ZMAT4Q9H898 229 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 PALMDQ9NP74 551 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 BATF3Q9NR55 127 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 NUDT15Q9NV35 164 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 A8MZ25 164 aa6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 K7EMT4 169 aa6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 CCSO14618 274 aa6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 CHEK1O14757 476 aa6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 NPBWR1P48145 328 aa6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 CD69Q07108 199 aa6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF846Q147U1 533 aa6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 SMPXQ9UHP9 88 aa6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 H3BP45 60 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 FAM229AH3BQW9 127 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 SYNGR2O43760 224 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 IFNA10P01566 189 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 PAX9P55771 341 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 CD81P60033 236 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 GUCA2BQ16661 112 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 COQ8AQ8NI60 647 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 ST8SIA2Q92186 375 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 RNF2Q99496 336 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 NEURL2Q9BR09 285 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 VSIRQ9H7M9 311 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 U3KQ87 197 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 WRBO00258 174 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 TSPAN4O14817 238 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 CCNKO75909 580 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 YIF1AO95070 293 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 SLC25A4P12235 298 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 OR10J1P30954 320 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 GAMTQ14353 236 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 TOR2AQ5JU69 321 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 DEFB125Q8N687 156 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 NPIPB3Q92617 1050 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 ACY3Q96HD9 319 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 RYR3Q15413 4870 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 SSSCA1O60232 199 aa6.35□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 IFNA4P05014 189 aa6.35□□□□□ -1.39
CCDC33-211ENST00000563951 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms