RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552189.5

SENP1-210, Transcript of SUMO specific peptidase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SENP1, Length 4,967 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1-210ENST00000552189 GUSBP1Q15486 140 aa6.41□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.41□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.41□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 CBY3A6NI87 242 aa6.41□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 CD5LO43866 347 aa6.41□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.41□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.41□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.41□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.41□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 HMSDA8MTL9 139 aa6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 BLCAPP62952 87 aa6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 LEMD1Q68G75 181 aa6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 RAB24Q969Q5 203 aa6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 FAM223BA6NKX1 122 aa6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 ELANEP08246 267 aa6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 STPG2Q8N412 459 aa6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SENP1-210ENST00000552189 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.4□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.4□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.4□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.4□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.4□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 LMO4P61968 165 aa6.4□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 ZNF429Q86V71 674 aa6.4□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 A0A0B4J293 547 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 CD5P06127 495 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 LCN12Q6JVE5 192 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 OR52E5Q8NH55 327 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 ATG101Q9BSB4 218 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 CENPEQ02224 2701 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 TMEM189A5PLL7 270 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 FCN1O00602 326 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 TBX15Q96SF7 602 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 LDLRAD4O15165 306 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 HLA-DRB1P01911 266 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 A0A1B0GWJ7 208 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 LHBP01229 141 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 NTF3P20783 257 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 MST1LQ2TV78 715 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 IFT22Q9H7X7 185 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 VAX2Q9UIW0 290 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 G3V3Q6 166 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 SEC11BP0C7V7 166 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 FCER1GP30273 86 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 CD81P60033 236 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 SMR3AQ99954 134 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 GGACTQ9BVM4 153 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 CCL24O00175 119 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 ITGB1BP1O14713 200 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 HERPUD1Q15011 391 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 DEFB136Q30KP8 78 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 LINC00311Q8N616 119 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 ZMAT4Q9H898 229 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 TMEM262E9PQX1 116 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 TGOLN2O43493 480 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 SMUG1Q53HV7 270 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 GPR82Q96P67 336 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 C5orf42Q9H799 3197 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 MPTX1A8MV57 137 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 PSG1P11464 419 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.9 ms