RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548220.1

PTPRR-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRR, Length 1,374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-207ENST00000548220 JTBO76095 146 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 IFNA4P05014 189 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 FABP1P07148 127 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 OR8U8P0C7N1 319 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 AREGP15514 252 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 PROK1P58294 105 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 LINC00310P59036 64 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 DLK1P80370 383 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 CD69Q07108 199 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 ZNF266Q14584 549 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 SPANXN5Q5MJ07 72 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 C10orf55Q5SWW7 151 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 SPSB3Q6PJ21 355 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 Q8N1Y9 231 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 OR4X1Q8NH49 305 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 SUN5Q8TC36 379 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 ABHD5Q8WTS1 349 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 TMEM158Q8WZ71 300 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 LINC00052Q96N35 136 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 HINT2Q9BX68 163 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 MAGT1Q9H0U3 335 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 NPVFQ9HCQ7 196 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 RNF24Q9Y225 148 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 FBXO7Q9Y3I1 522 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 RAB19A4D1S5 217 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 LINC01548A6NM66 108 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 TEX46H3BTG2 121 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 I3L2K1 104 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 SCGB1D2O95969 90 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 OPN1MWP04001 364 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 OPN1MW2P0DN77 364 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 OPN1MW3P0DN78 364 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 MDKP21741 143 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 S100A7P31151 101 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 NPBWR1P48145 328 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 RAB9AP51151 201 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 CAV2P51636 162 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 MFAP4P55083 255 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 SELENOTP62341 195 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 RAB31Q13636 194 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 C9orf152Q5JTZ5 239 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 PXDC1Q5TGL8 231 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 SLC25A24Q6NUK1 477 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 UQCC3Q6UW78 93 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 ETV3LQ6ZN32 361 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 TMEM144Q7Z5S9 345 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 KLHDC1Q8N7A1 406 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 UBAC2Q8NBM4 344 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 OR4X2Q8NGF9 303 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 OR1S2Q8NGQ3 325 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 TMEM170AQ8WVE7 144 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 MARC2Q969Z3 335 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 C19orf24Q9BVV8 132 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 KCNIP2Q9NS61 270 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 X6R8D5 127 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 G3V318 75 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 HOXA5P20719 270 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 RIPPLY3P57055 190 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 BLOC1S1P78537 153 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 RHOGP84095 191 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 ATP5G2Q06055 141 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 C15orf32Q32M92 178 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 ZNF343Q6P1L6 599 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 S100A7AQ86SG5 101 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 THAP8Q8NA92 274 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 OR5T1Q8NG75 326 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 OR5AU1Q8NGC0 362 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 TMED6Q8WW62 240 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 TMEM147Q9BVK8 224 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 ARV1Q9H2C2 271 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 UQCC1Q9NVA1 299 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 C21orf62Q9NYP8 219 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 FBXL17Q9UF56 701 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 CUBNO60494 3623 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRR-207ENST00000548220 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRR-207ENST00000548220 K7EIM0 57 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRR-207ENST00000548220 CLN5O75503 358 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRR-207ENST00000548220 SCO1O75880 301 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRR-207ENST00000548220 TRGV3P03979 118 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRR-207ENST00000548220 METTL15P1P0C7V9 234 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRR-207ENST00000548220 IAPPP10997 89 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRR-207ENST00000548220 MYOD1P15172 320 aa4.83□□□□□ -1.64
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