RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 ITPR3Q14573 2671 aa6.96□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 ZNF320A2RRD8 509 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 CNTFRP26992 372 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 RAB4BP61018 213 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 PSG5Q15238 335 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 IQCJQ1A5X6 159 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 FAM78BQ5VT40 261 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 SSX7Q7RTT5 188 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 OR5R1Q8NH85 324 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 Q96MF0 132 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 ABCA1O95477 2261 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 NUPR1O60356 82 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 MOSP00540 346 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 CD24P25063 80 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 HBG1P69891 147 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 HBG2P69892 147 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 PRCDQ00LT1 54 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 HES1Q14469 280 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 AJUBAQ96IF1 538 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 NOTCH2Q04721 2471 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 CBY3A6NI87 242 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 IGHV1-69P01742 117 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 MMDQ15546 238 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 MMD2Q8IY49 270 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 IMMP2LQ96T52 175 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 C15orf62A8K5M9 175 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 CRYGBP07316 175 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 BSXQ3C1V8 233 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 ZNF709Q8N972 641 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 ATP5SQ99766 215 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 E7EUB6 86 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 ACTL6BO94805 426 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 TGFAP01135 160 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 BCL2P10415 239 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 ERVFC1-1P60608 527 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 PLGLAQ15195 96 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 FBLN7Q53RD9 439 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 PRR31Q5SQ13 230 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 ATOH7Q8N100 152 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 FBXL15Q9H469 300 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 NAGKQ9UJ70 344 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 CR1P17927 2039 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 RRHO14718 337 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 NBR2O15453 112 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 BRS3P32247 399 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 KRTDAPP60985 99 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 BTF3L4Q96K17 158 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 PDZD2O15018 2839 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 A0A087WWC5 75 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 TNXAQ16473 311 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 NPBQ8NG41 125 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.93□□□□□ -1.3
THBS3-210ENST00000541576 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.93□□□□□ -1.3
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