RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514380.5

RBPJ-225, Transcript of recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region, human

TSL 2

Gene RBPJ, Length 1,519 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBPJ-225	ENST00000514380	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380		A0A0G2JLM5	398 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	FAM223B	A6NKX1	122 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	CST7	O76096	145 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	MT-CO2	P00403	227 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	IGHV3-11	P01762	117 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	IGHV3-48	P01763	117 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	SLC25A4	P12235	298 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	LYL1	P12980	280 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	OPRK1	P41145	380 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	ODF1	Q14990	250 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	KLK9	Q2XQG4	91 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	TEPP	Q6URK8	271 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	STX12	Q86Y82	276 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	RNF152	Q8N8N0	203 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	USMG5	Q96IX5	58 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380		S4R3C0	116 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	IGSF23	A1L1A6	192 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380		G3V3Q6	166 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380		I3L2K1	104 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380		K7EIM0	57 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	PFDN1	O60925	122 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	IGHV3-23	P01764	117 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	SULT1A1	P50225	295 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	KRTAP10-3	P60369	221 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	NHLH2	Q02577	135 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	CD300C	Q08708	224 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	CT83	Q5H943	113 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	ZNF546	Q86UE3	836 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	CXorf58	Q96LI9	332 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	OR5B12	Q96R08	314 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380		A0A1W2PRX2	142 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	PRSS46	E5RG02	174 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	CLEC3B	P05452	202 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	S100A11	P31949	105 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	NPBWR1	P48145	328 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	MFAP4	P55083	255 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	HBG1	P69891	147 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	HBG2	P69892	147 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	CD69	Q07108	199 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	BAX	Q07812	192 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	ARL16	Q0P5N6	197 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380		Q56UQ5	140 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	ACSM6	Q6P461	480 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	SLC35E1	Q96K37	410 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	NEURL2	Q9BR09	285 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	GNB4	Q9HAV0	340 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	SMCO3	A2RU48	225 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	OR2T8	A6NH00	312 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	ARPC5	O15511	151 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBPJ-225	ENST00000514380	C1QB	P02746	253 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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