RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 NECAP1Q8NC96 275 aa5.6□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 OR1P1Q8NH06 330 aa5.6□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 OR1S1Q8NH92 325 aa5.6□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 PDCD10Q9BUL8 212 aa5.6□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 FBXL7Q9UJT9 491 aa5.6□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 A0A0G2JLM5 398 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 NUPR2A6NF83 97 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 CEBPZOSA8MTT3 80 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 FAM90A26D6RGX4 464 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 I3L2K1 104 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 RTL8CO15255 209 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 DHFRP00374 187 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 IFNA21P01568 189 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 IGLV1-51P01701 117 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 IGHV3-23P01764 117 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 DEFA4P12838 97 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 ERHP84090 104 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 IL15RAQ13261 267 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 TATDN3Q17R31 274 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 RGS21Q2M5E4 152 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 SLC25A24Q6NUK1 477 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 DTD1Q8TEA8 209 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 USMG5Q96IX5 58 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 MAGT1Q9H0U3 335 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 TUBA4BQ9H853 241 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 ALG5Q9Y673 324 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 U3KQE9 123 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf135-204ENST00000495399 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 ANKRD34BA5PLL1 514 aa5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 C15orf62A8K5M9 175 aa5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 BMPR1BO00238 502 aa5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 SYNGR2O43760 224 aa5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 CDK2AP2O75956 126 aa5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 SIX6O95475 246 aa5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM50AO95807 157 aa5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 IAPPP10997 89 aa5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 PAX9P55771 341 aa5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 ATP5G2Q06055 141 aa5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 PMS2P11Q13670 270 aa5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 C2orf83Q53S99 150 aa5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 SLC24A4Q8NFF2 622 aa5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 VN1R17PQ8TDU5 208 aa5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 CACFD1Q9UGQ2 172 aa5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 CXorf65A6NEN9 183 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 FAM25EA8MYX2 175 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 PRSS46E5RG02 174 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 PPP5D1E7EU14 171 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 K7EPK0 472 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 WRBO00258 174 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 GOSR2O14653 212 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 MT-CO2P00403 227 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 IGHV3-48P01763 117 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 SNCAP37840 140 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 HTR2BP41595 481 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 H2BFSP57053 126 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 LINC00310P59036 64 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 CLEC19AQ6UXS0 136 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 GSG1LQ6UXU4 331 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 OR11H7Q8NGC8 314 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 CXorf58Q96LI9 332 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 C2orf50Q96LR7 162 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 ENY2Q9NPA8 101 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 THYN1Q9P016 225 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 GSKIPQ9P0R6 139 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 U3KQ87 197 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 IZUMO1RA6ND01 250 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 C5orf51A6NDU8 294 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 PMS2P5A8MQ11 134 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 H3BP45 60 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 CYB5BO43169 146 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 SSSCA1O60232 199 aa5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms