RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 NOTCH2Q04721 2471 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 ZFP92A6NM28 416 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 NUDT19A8MXV4 375 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 IGKV1-17P01599 117 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 IGHV3-48P01763 117 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 IGHG4P01861 327 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 NPBWR1P48145 328 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 MFAP4P55083 255 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 PLP1P60201 277 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 RHOGP84095 191 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 C15orf32Q32M92 178 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 TNFRSF19Q9NS68 423 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 LINC00527Q9UJ94 153 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 SONP18583 2426 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 PSMB8P28062 276 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF90Q03938 601 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF616Q08AN1 781 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 IL34Q6ZMJ4 242 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 SSX7Q7RTT5 188 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 CCDC140Q96MF4 163 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 C19orf24Q9BVV8 132 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 TOMM40O96008 361 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 FABP1P07148 127 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 OR5G3P0C626 314 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 DEFA5Q01523 94 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 COMMD1Q8N668 190 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 RNF152Q8N8N0 203 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 USMG5Q96IX5 58 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 DUX5Q96PT3 197 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 HIVEP2P31629 2446 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 INAFM1C9JVW0 142 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 GNG7O60262 68 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 SCGB2A1O75556 95 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 OR2C1O95371 312 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 HBE1P02100 147 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 TRGV3P03979 118 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 CTSGP08311 255 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 ADMP35318 185 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 TIGITQ495A1 244 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 Q6ZSV7 163 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 COMMD7Q86VX2 200 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 JMJD8Q96S16 334 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 PFDN5Q99471 154 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 RNF2Q99496 336 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 SLC25A22Q9H936 323 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 HIVEP1P15822 2718 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 RAB19A4D1S5 217 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 ELANEP08246 267 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 STAG3L2P0CL84 134 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 STAG3L3P0CL85 134 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 PSG1P11464 419 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 TPPP2P59282 170 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 RHOBP62745 196 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 SLC35B1P78383 322 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 ATP5G2Q06055 141 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 FOXE3Q13461 319 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 PMS2P11Q13670 270 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 Q56UQ5 140 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 FAM209BQ5JX69 171 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms