RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 COX7A2P2O60397 106 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 IGHV1-46P01743 117 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 REG1AP05451 166 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 USF1P22415 310 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 SRIP30626 198 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 SLC35B1P78383 322 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 RASL11AQ6T310 242 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 BORCS7Q96B45 105 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.07□□□□□ -1.28
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PKP4-210ENST00000480171 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.06□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 A0A1W2PS18 150 aa7.06□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
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PKP4-210ENST00000480171 IGLV2-8P01709 118 aa7.06□□□□□ -1.28
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PKP4-210ENST00000480171 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.06□□□□□ -1.28
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PKP4-210ENST00000480171 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa7.06□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
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PKP4-210ENST00000480171 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.06□□□□□ -1.28
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PKP4-210ENST00000480171 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.06□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 OR4A5Q8NH83 315 aa7.06□□□□□ -1.28
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PKP4-210ENST00000480171 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
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PKP4-210ENST00000480171 DLEU1O43261 78 aa7.05□□□□□ -1.28
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PKP4-210ENST00000480171 TMEM177Q53S58 311 aa7.05□□□□□ -1.28
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PKP4-210ENST00000480171 DSCAML1Q8TD84 2053 aa7.05□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 DSCAMO60469 2012 aa7.05□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.05□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 PEX7O00628 323 aa7.05□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 CRYABP02511 175 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
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PKP4-210ENST00000480171 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.05□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.05□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.05□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.05□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 DPRXA6NFQ7 191 aa7.04□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 H0YJW9 148 aa7.04□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 CHRNB4P30926 498 aa7.04□□□□□ -1.28
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PKP4-210ENST00000480171 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa7.04□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 TSKUQ8WUA8 353 aa7.04□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 TMEM186Q96B77 213 aa7.04□□□□□ -1.28
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PKP4-210ENST00000480171 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.04□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 PSMB11A5LHX3 300 aa7.04□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 SNAI2O43623 268 aa7.04□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 NTF3P20783 257 aa7.04□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 ZNF329Q86UD4 541 aa7.04□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 PDPNQ86YL7 162 aa7.04□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 Q8N976 141 aa7.04□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.04□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.04□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 PCNX2A6NKB5 2137 aa7.04□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 C3orf79P0CE67 100 aa7.03□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 WT1P19544 449 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 MFAP2P55001 183 aa7.03□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 UBE2G1P62253 170 aa7.03□□□□□ -1.28
PKP4-210ENST00000480171 PMCHL1Q16048 86 aa7.03□□□□□ -1.28
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