RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IL15RAQ13261 267 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C11orf87Q6NUJ2 197 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VSIRQ9H7M9 311 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IFNA10P01566 189 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IFNA21P01568 189 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PAX9P55771 341 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MARVELD1Q9BSK0 173 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 U3KQE9 123 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRAV6A0A075B6T7 132 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHEK1O14757 476 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CD5P06127 495 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CRYBB3P26998 211 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RND2P52198 227 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TAS2R30P59541 319 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GAMTQ14353 236 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NRARPQ7Z6K4 114 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR52B4Q8NGK2 314 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMIM8Q96KF7 97 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GINS3Q9BRX5 216 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SNRPGP15A8MWD9 76 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAB11AP62491 216 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPP30P78346 268 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BTNL8Q6UX41 500 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC16A13Q7RTY0 426 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NPIPB3Q92617 1050 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FNDC10F2Z333 226 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WRBO00258 174 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRAF2O60831 178 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SCGB2A1O75556 95 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TOMM40O96008 361 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IFNA4P05014 189 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CD7P09564 240 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR10J1P30954 320 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TIGITQ495A1 244 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 THAP8Q8NA92 274 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAB40CQ96S21 281 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NEURL2Q9BR09 285 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SEC22CQ9BRL7 303 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAGT1Q9H0U3 335 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TSC22D2O75157 780 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 YIF1AO95070 293 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MBPP02686 304 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IAPPP10997 89 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NPPCP23582 126 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LILRB2Q8N423 598 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ENKURQ8TC29 256 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q8WTZ3 238 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C2orf50Q96LR7 162 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RNF2Q99496 336 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A1W2PS18 150 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C7orf66A4D0T2 115 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RD3LP0DJH9 198 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PSG1P11464 419 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BMI1P35226 326 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DEFA1P59665 94 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DEFA3P59666 94 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CD81P60033 236 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GUCA2BQ16661 112 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRGV9Q99603 122 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR4C46A6NHA9 309 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms