RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSENENQ9NZ42 101 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSC22D2O75157 780 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCGB1D2O95969 90 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MBPP02686 304 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGLC1P0CG04 106 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC35E1Q96K37 410 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C7orf66A4D0T2 115 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 YIF1AO95070 293 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGKV1-17P01599 117 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPNP16150 400 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10J1P30954 320 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BMI1P35226 326 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYCSP99999 105 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL15RAQ13261 267 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEFB114Q30KQ6 69 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TM4SF20Q53R12 229 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPIPB3Q92617 1050 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C20orf24Q9BUV8 137 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRSS46E5RG02 174 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 L7N2F9 121 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GHRHP01286 108 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FABP1P07148 127 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GP9P14770 177 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PAX9P55771 341 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VAMP2P63027 116 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAMTQ14353 236 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RGS21Q2M5E4 152 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TOMM20LQ6UXN7 152 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q8WTZ3 238 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACY3Q96HD9 319 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF414Q96IQ9 312 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP11.58□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV25A0A0B4J276 109 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H3BP45 60 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 K7EPK0 472 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOSR2O14653 212 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SSNA1O43805 119 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD5P06127 495 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRAPQ8TCY5 172 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NMES1Q9C002 83 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FNDC10F2Z333 226 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 K7EIL1 84 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TOMM40O96008 361 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TIGITQ495A1 244 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HAPLN4Q86UW8 402 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10P1Q8NGE3 313 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GGACTQ9BVM4 153 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MLXQ9UH92 298 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMPXQ9UHP9 88 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZFP92A6NM28 416 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RD3LP0DJH9 198 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BTNL8Q6UX41 500 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRR25Q96S07 402 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PS18 150 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PMS2P5A8MQ11 134 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CFDP00746 253 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RLN2P04090 185 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EDN2P20800 178 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPPCP23582 126 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 S100A10P60903 97 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DLK1P80370 383 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB32Q13637 225 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM144Q7Z5S9 345 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GTSCR1Q86UQ5 136 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 THAP8Q8NA92 274 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 METTL26Q96S19 204 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRGV9Q99603 122 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C11orf1Q9H5F2 150 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM231Q9H6L2 316 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHEK1O14757 476 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSPAN4O14817 238 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 METTL15P1P0C7V9 234 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRYBB3P26998 211 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAV2P51636 162 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H2BFSP57053 126 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OXA1LQ15070 435 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR8G2PQ6IF36 304 aa11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms