RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa20.19■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa20.19■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 SYNGR2O43760 224 aa20.19■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 NOXA1Q86UR1 476 aa20.19■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 OR4D5Q8NGN0 318 aa20.19■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 OR10J1P30954 320 aa20.18■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 LILRB2Q8N423 598 aa20.18■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
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TPGS1-201ENST00000359315 H3BP45 60 aa20.17■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 CCSO14618 274 aa20.17■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 TSPAN4O14817 238 aa20.17■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 MED6O75586 246 aa20.17■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 ID3Q02535 119 aa20.17■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 ETFRF1Q6IPR1 90 aa20.17■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 OR1S2Q8NGQ3 325 aa20.17■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 ST8SIA2Q92186 375 aa20.17■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 GINS3Q9BRX5 216 aa20.17■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 TUBA4BQ9H853 241 aa20.17■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa20.16■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 OR11H12B2RN74 326 aa20.16■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 IFNA21P01568 189 aa20.16■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 H2AFB2P0C5Z0 115 aa20.16■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 SRD5A3Q9H8P0 318 aa20.16■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 FAM90A2PQ658T7 463 aa20.15■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 MZT2BQ6NZ67 158 aa20.15■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 VSIRQ9H7M9 311 aa20.15■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 U3KQK5 164 aa20.15■□□□□ 0.82
TPGS1-201ENST00000359315 COL7A1Q02388 2944 aa20.14■□□□□ 0.82
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TPGS1-201ENST00000359315 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 GAMTQ14353 236 aa20.14■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 UBQLN2Q9UHD9 624 aa20.14■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa20.13■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa20.13■□□□□ 0.81
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TPGS1-201ENST00000359315 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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TPGS1-201ENST00000359315 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa20.13■□□□□ 0.81
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TPGS1-201ENST00000359315 TM2D3Q9BRN9 247 aa20.12■□□□□ 0.81
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TPGS1-201ENST00000359315 TFPI2P48307 235 aa20.11■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 ODF3L2Q3SX64 289 aa20.11■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 TCF24Q7RTU0 167 aa20.11■□□□□ 0.81
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TPGS1-201ENST00000359315 TOMM40O96008 361 aa20.1■□□□□ 0.81
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TPGS1-201ENST00000359315 CRYBB3P26998 211 aa20.1■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 PAX9P55771 341 aa20.1■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 GBGT1Q8N5D6 347 aa20.1■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 ENKURQ8TC29 256 aa20.1■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 Q8WTZ3 238 aa20.1■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 RCHY1Q96PM5 261 aa20.1■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 METTL26Q96S19 204 aa20.1■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
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TPGS1-201ENST00000359315 IL4P05112 153 aa20.09■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 PSG1P11464 419 aa20.09■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF90Q03938 601 aa20.09■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 NRARPQ7Z6K4 114 aa20.09■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 PSENENQ9NZ42 101 aa20.09■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TPGS1-201ENST00000359315 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa20.08■□□□□ 0.81
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TPGS1-201ENST00000359315 OR4C46A6NHA9 309 aa20.07■□□□□ 0.8
TPGS1-201ENST00000359315 ZFP92A6NM28 416 aa20.07■□□□□ 0.8
TPGS1-201ENST00000359315 FAM25EA8MYX2 175 aa20.07■□□□□ 0.8
TPGS1-201ENST00000359315 RD3LP0DJH9 198 aa20.07■□□□□ 0.8
TPGS1-201ENST00000359315 RPP30P78346 268 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TPGS1-201ENST00000359315 PMS2P5A8MQ11 134 aa20.06■□□□□ 0.8
TPGS1-201ENST00000359315 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa20.06■□□□□ 0.8
TPGS1-201ENST00000359315 OR51G1Q8NGK1 321 aa20.06■□□□□ 0.8
TPGS1-201ENST00000359315 IL5P05113 134 aa20.05■□□□□ 0.8
TPGS1-201ENST00000359315 BMI1P35226 326 aa20.05■□□□□ 0.8
TPGS1-201ENST00000359315 P2RY1P47900 373 aa20.05■□□□□ 0.8
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF124Q15973 351 aa20.05■□□□□ 0.8
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