RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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HOXC11-201ENST00000243082 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.63□□□□□ -0.07
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HOXC11-201ENST00000243082 CD99P14209 185 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC11-201ENST00000243082 RPL35P42766 123 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
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HOXC11-201ENST00000243082 OR5B12Q96R08 314 aa14.6□□□□□ -0.07
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HOXC11-201ENST00000243082 TIGITQ495A1 244 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC11-201ENST00000243082 FANCD2OSQ96PS1 177 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC11-201ENST00000243082 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC11-201ENST00000243082 S100A6P06703 90 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF843Q8N446 348 aa14.59□□□□□ -0.07
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HOXC11-201ENST00000243082 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
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HOXC11-201ENST00000243082 CLEC2AQ6UVW9 174 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 LY96Q9Y6Y9 160 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa14.58□□□□□ -0.08
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HOXC11-201ENST00000243082 S100PP25815 95 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 C1RLQ9NZP8 487 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF462Q96JM2 2506 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 PPP1R2P9O14990 202 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 SRP14P37108 136 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 STXBP6Q8NFX7 210 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 TEX38Q6PEX7 206 aa14.56□□□□□ -0.08
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