RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 ClmQ7TSN2 230 aa13.22□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 PigmQ8C2R7 423 aa13.22□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr979Q8VH10 311 aa13.22□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 ChodlQ9CXM0 273 aa13.22□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Golt1aQ9DCQ3 133 aa13.22□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 RbpmsQ9WVB0 197 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trav18A0A075B656 109 aa13.21□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Arl16B1ATY8 173 aa13.21□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lin7cO88952 197 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gpr12P35412 334 aa13.21□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cdkn1aP39689 159 aa13.21□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lhx4P53776 390 aa13.21□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ear1P97426 155 aa13.21□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem52bQ0VBF2 186 aa13.21□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 YrdcQ3U5F4 280 aa13.21□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp663Q6NXM6 656 aa13.21□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ceacam9Q78T27 234 aa13.21□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Scnm1Q8K136 229 aa13.21□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1462Q8VFW3 307 aa13.21□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr167Q8VGJ5 312 aa13.21□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Plekhf2Q91WB4 249 aa13.21□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ndufaf3Q9JKL4 185 aa13.21□□□□□ -0.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ighv5-8A0A075B676 92 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trbv26A0A0B4J1P5 115 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam98cE9PYD1 344 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm21970F6XX07 295 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tnfaip6O08859 275 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 SlbpP97440 275 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1396Q7TQS8 315 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rbpms2Q8VC52 206 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr492Q8VFD1 314 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr523Q8VFE7 317 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rpp14Q9CQH8 122 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Aifm1Q9Z0X1 612 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sdk1Q3UH53 2193 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 ColqO35348 457 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lyz1P17897 148 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ap2s1P62743 142 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dlx6P70397 175 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pate4Q09098 99 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zic4Q61467 341 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tle4Q62441 773 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Foxb2Q64733 428 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Arl6ip6Q8BH07 226 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mef2cQ8CFN5 474 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 TprkbQ8QZZ7 175 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pbp2Q8VIN1 187 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc22a26Q91WJ2 552 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hnf4gQ9WUU6 408 aa13.2□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cmya5Q70KF4 3739 aa13.19□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tln2Q71LX4 2375 aa13.19□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Msl3l2G3X992 371 aa13.19□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 P01759 136 aa13.19□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Defb18Q30KP5 85 aa13.19□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1168Q7TR25 312 aa13.19□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr452Q7TRV8 317 aa13.19□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ankrd55Q8BLD6 626 aa13.19□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr827Q8VEV5 322 aa13.19□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr38Q8VGP4 317 aa13.19□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 HpxQ91X72 460 aa13.19□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ms4a8Q99N10 290 aa13.19□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cldn34dA2AGU5 210 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ly6g6fB2RXM6 300 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Prr23a2D3YWX5 253 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 OpcmlG5E8G3 345 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sult2a5K7N6K9 285 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1053L7MU59 313 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm5458L7N219 204 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Bpifa2P07743 235 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lsm5P62322 91 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Q0VG49 157 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 HykkQ5U5V2 376 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 SlaQ60898 281 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1341Q7TQV4 312 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rnf170Q8CBG9 286 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dctn4Q8CBY8 467 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dcun1d4Q8CCA0 292 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Eif2b2Q99LD9 351 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sytl3Q99N48 607 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 H2afb1Q9CQ70 111 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Med30Q9CQI9 178 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam3bQ9D309 235 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Eaf1Q9D4C5 268 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Eif3fQ9DCH4 361 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr716Q9EPG6 314 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 LystP97412 3788 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr267A2AM35 313 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 H2-M5A7VMS3 348 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ercc1P07903 298 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Defa-rs1P17533 116 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fgf8P37237 268 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rab7aP51150 207 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 SgcaP82350 387 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tff1Q08423 87 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nmes1Q810Q5 83 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ptrh2Q8R2Y8 181 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 St3gal6Q8VIB3 329 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rnaseh2cQ9CQ18 166 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Uqcrfs1Q9CR68 274 aa13.18□□□□□ -0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Timm9Q9WV98 89 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.9 ms