RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	C16orf95	Q9H693	158 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576		S4R3C0	116 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0D9SG52	128 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576		I3L2K1	104 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRGV3	P03979	118 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSMB8	P28062	276 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	CD69	Q07108	199 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	C15orf32	Q32M92	178 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMUB2	Q71RG4	321 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	WFDC1	Q9HC57	220 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	THYN1	Q9P016	225 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	COL6A5	A8TX70	2615 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	TPPP2	P59282	170 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLK9	Q2XQG4	91 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	TEX38	Q6PEX7	206 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	NECAP1	Q8NC96	275 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR4F5	Q8NH21	305 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		7.13	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAB9A	P51151	201 aa		7.13	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		7.13	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		7.13	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		7.13	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	MARC2	Q969Z3	335 aa		7.13	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMCO3	A2RU48	225 aa		7.13	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576		H3BUA1	57 aa		7.13	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	HAX1	O00165	279 aa		7.13	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	GAMT	Q14353	236 aa		7.13	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		7.13	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACY3	Q96HD9	319 aa		7.13	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	BRI3	O95415	125 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	DLK1	P80370	383 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP5S	Q99766	215 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	GGACT	Q9BVM4	153 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF114	Q9Y508	228 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	TSPAN4	O14817	238 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	BCL2L11	O43521	198 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV3-23	P01764	117 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	FOXE3	Q13461	319 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	RND2	P52198	227 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	AKR1C1	Q04828	323 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP6V1F	Q16864	119 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	VWC2	Q2TAL6	325 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACSM6	Q6P461	480 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPIPB3	Q92617	1050 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC35E1	Q96K37	410 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM223B	A6NKX1	122 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	TAAR5	O14804	337 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	DFFB	O76075	338 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	ELANE	P08246	267 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP5G2	Q06055	141 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	OPCML	Q14982	345 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	TREML4	Q6UXN2	200 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	STAB1	Q9NY15	2570 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM89	A2RUT3	159 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV3-11	P01762	117 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	PROK1	P58294	105 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF266	Q14584	549 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	CXorf58	Q96LI9	332 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00862	A6NCI5	91 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	FNDC10	F2Z333	226 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF152	Q8N8N0	203 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	USMG5	Q96IX5	58 aa		7.11	□□□□□ -1.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms