RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 PVRIGQ6DKI7 326 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 PDPNQ86YL7 162 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 SAMD12Q8N8I0 201 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 BEST4Q8NFU0 473 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 OR10G7Q8NGN6 311 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC25A38Q96DW6 304 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 HSPB9Q9BQS6 159 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 FBXL15Q9H469 300 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 COMMD3Q9UBI1 195 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF580Q9UK33 172 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 WSB1Q9Y6I7 421 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 PRAC2D3DTV9 90 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 PRSS1P07477 247 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 MYCNOSP40205 109 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 ARPC4P59998 168 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL8P62917 257 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 DEFA6Q01524 100 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 RTL8BQ17RB0 113 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 AKIRIN2Q53H80 203 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 STPG4Q8N801 248 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 OR2D2Q9H210 308 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 EHFQ9NZC4 300 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 FBN3Q75N90 2809 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 TNCP24821 2201 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAV41A0A0B4J266 112 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 TEX46H3BTG2 121 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV1-16P04430 117 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 PTHLHP12272 177 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 CD40LGP29965 261 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL5P46777 297 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 TAS2R20P59543 309 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 DHODHQ02127 395 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 FXYD3Q14802 87 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 CDK10Q15131 360 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM69Q5SWH9 247 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP1R27Q86WC6 154 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF695Q8IW36 515 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF645Q8N7E2 425 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 AP3S1Q92572 193 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 CCL28Q9NRJ3 127 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 NECAP2Q9NVZ3 263 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM25AB3EWG3 89 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM25CB3EWG5 89 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM25GB3EWG6 89 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 G3V318 75 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 H3BMQ9 156 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 K7EQD1 137 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 SULT1C2O00338 296 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 CNIH1O95406 144 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLV2-23P01705 113 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 ELK1P19419 428 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 PSMB8P28062 276 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 TMBIM6P55061 237 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 MSMO1Q15800 293 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 VAMP3Q15836 100 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 VMA21Q3ZAQ7 101 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF491Q8N8L2 437 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 C15orf40Q8WUR7 153 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 BORCS5Q969J3 196 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 IFT46Q9NQC8 304 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 PARP11Q9NR21 331 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 VSIG4Q9Y279 399 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.82□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa5.82□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 MEIS3P1A6NDR6 274 aa5.82□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 HPGDSO60760 199 aa5.82□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 GABARAPO95166 117 aa5.82□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 CRYZL1O95825 349 aa5.82□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 PPYP01298 95 aa5.82□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 PMP2P02689 132 aa5.82□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV1-13P0DP09 117 aa5.82□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE2KP61086 200 aa5.82□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL30P62888 115 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 ARL16Q0P5N6 197 aa5.82□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 ACTBL2Q562R1 376 aa5.82□□□□□ -1.48
EFTUD2-216ENST00000590105 LPCAT3Q6P1A2 487 aa5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms