RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 SORL1Q92673 2214 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 GOSR2O14653 212 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 BCL2L11O43521 198 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 RAB3DO95716 219 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 RLN2P04090 185 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 CLEC3BP05452 202 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINE2P07093 398 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 MEOX2P50222 304 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 PIGPP57054 158 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 TAS2R19P59542 299 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 LCN12Q6JVE5 192 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF546Q86UE3 836 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 OR4A16Q8NH70 328 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 STOML3Q8TAV4 291 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM56Q96MV1 263 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 MLXQ9UH92 298 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 PRNDQ9UKY0 176 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 U3KQK5 164 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-214ENST00000583153 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SIX6O95475 246 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 CD74P04233 296 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 PI3P19957 117 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 TBPP20226 339 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 GPR183P32249 361 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 GPHB5Q86YW7 130 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 OR5B3Q8NH48 314 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 TERB2Q8NHR7 220 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC140Q96MF4 163 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 C12orf57Q99622 126 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 TUBA4BQ9H853 241 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 MBD2Q9UBB5 411 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 C2orf70A6NJV1 201 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 DISC1C4P0D8 188 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 LGALS9O00182 355 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 OR4E1P0C645 316 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 AKR1C2P52895 323 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 WT1-ASQ06250 92 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 MEF2DQ14814 521 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SP6Q3SY56 376 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 RNF212Q495C1 297 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 Q56UQ5 140 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SEC11CQ9BY50 192 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 ZMAT4Q9H898 229 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 TENM3Q9P273 2699 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 OR2T8A6NH00 312 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 C15orf61A6NNL5 157 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 IFNA17P01571 189 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV1-39P01597 117 aa6.31□□□□□ -1.4
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