RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 C17orf77Q96MU5 243 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRNDQ9UKY0 176 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 IFITM5A6NNB3 132 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 ATP6V1G2O95670 118 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGKV3-20P01619 116 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 FXYD4P59646 89 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 DEFB1P60022 68 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 FABP5Q01469 135 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 SSX7Q7RTT5 188 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 TPRA1Q86W33 373 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 FCAMRQ8WWV6 532 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 UFD1Q92890 307 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 VCXQ9H320 206 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 FKBP11Q9NYL4 201 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 U3KQE9 123 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 HBE1P02100 147 aa7.25□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 F2RP25116 425 aa7.25□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 GNRHRP30968 328 aa7.25□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 LPAR6P43657 344 aa7.25□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 ALDH3B2P48448 385 aa7.25□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 KRTAP10-1P60331 282 aa7.25□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 TTC32Q5I0X7 151 aa7.25□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 C16orf54Q6UWD8 224 aa7.25□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.25□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF709Q8N972 641 aa7.25□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 GLMPQ8WWB7 406 aa7.25□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF503Q96F45 646 aa7.25□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q9H3A6 140 aa7.25□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.25□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM229AH3BQW9 127 aa7.24□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 GNG2P59768 71 aa7.24□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 ARPC4P59998 168 aa7.24□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRAM1Q15629 374 aa7.24□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 RRN3P1Q2M238 152 aa7.24□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.24□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 IZUMO2Q6UXV1 221 aa7.24□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q6ZSN1 163 aa7.24□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM230Q96A57 120 aa7.24□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.24□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 F5H768 121 aa7.23□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 RLN1P04808 185 aa7.23□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRCDQ00LT1 54 aa7.23□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM17Q86X19 198 aa7.23□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 BEST4Q8NFU0 473 aa7.23□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 LGALS14Q8TCE9 139 aa7.23□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 RNF141Q8WVD5 230 aa7.23□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.23□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 NRN1Q9NPD7 142 aa7.23□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 A0A1W2PPQ1 181 aa7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 PTGES3LE9PB15 166 aa7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 PDCD5O14737 125 aa7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 CLN5O75503 358 aa7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGKV1-17P01599 117 aa7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRM2P04554 102 aa7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 HSMCR30P0CW71 290 aa7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 DEFB130BP0DP73 79 aa7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 DEFB130AP0DP74 79 aa7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 ERHP84090 104 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 CLINT1Q14677 625 aa7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 ICAM4Q14773 271 aa7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 MLANAQ16655 118 aa7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 TIGITQ495A1 244 aa7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 UHRF2Q96PU4 802 aa7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 TSC22D3Q99576 134 aa7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa7.21□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 FCER2P06734 321 aa7.21□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 LINC00315P59091 139 aa7.21□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 HAMPP81172 84 aa7.21□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 FCN2Q15485 313 aa7.21□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 SPINK9Q5DT21 86 aa7.21□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 HOGA1Q86XE5 327 aa7.21□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 SYT8Q8NBV8 401 aa7.21□□□□□ -1.26
CTDNEP1-202ENST00000570380 TSPAN14Q8NG11 270 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.9 ms