RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 WFDC1Q9HC57 220 aa6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 RFNGQ9Y644 331 aa6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 PSMB11A5LHX3 300 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 IGHV3-11P01762 117 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 NHLH2Q02577 135 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 SMIM8Q96KF7 97 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 DUX3Q96PT4 197 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 SPIN2AQ99865 258 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-211ENST00000561438 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.4□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 CST7O76096 145 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 ACTL6BO94805 426 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 ATG12O94817 140 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 CXCL2P19875 107 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 RHOGP84095 191 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 C2orf83Q53S99 150 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 OR1P1Q8NH06 330 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 OR5B12Q96R08 314 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 PPP5D1E7EU14 171 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 BRI3O95415 125 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 TRGV3P03979 118 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 NPY1RP25929 384 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 RAB9AP51151 201 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 TPPP2P59282 170 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 RAP2BP61225 183 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 FOXE3Q13461 319 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 OR4F5Q8NH21 305 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 CITED1Q99966 193 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 PSENENQ9NZ42 101 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 I3L521 148 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 BMPR1BO00238 502 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 TSC22D2O75157 780 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 MT-CO2P00403 227 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 CRYBA1P05813 215 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 SLC25A4P12235 298 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 C15orf32Q32M92 178 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 RAB24Q969Q5 203 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 RAB40CQ96S21 281 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 A0A087WW49 117 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 IFNA10P01566 189 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 IGKV1-17P01599 117 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 HTR2BP41595 481 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 CAV2P51636 162 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 TAS2R30P59541 319 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 GAMTQ14353 236 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 AKAP14Q86UN6 197 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 DCUN1D4Q92564 292 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 AQP10Q96PS8 301 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-211ENST00000561438 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms