RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	RAB24	Q969Q5	203 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	USMG5	Q96IX5	58 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	SOST	Q9BQB4	213 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC32	Q9BV29	185 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	NAA60	Q9H7X0	242 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	COMMD9	Q9P000	198 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	THYN1	Q9P016	225 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	DKK2	Q9UBU2	259 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	PRND	Q9UKY0	176 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	GPR132	Q9UNW8	380 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994		V9GYH0	126 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM223B	A6NKX1	122 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	TEX22	C9J3V5	150 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994		H0Y980	276 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994		H3BUA1	57 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	ST8SIA3	O43173	380 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	ATP6V1G1	O75348	118 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	UPK1B	O75841	260 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	IGKV1-39	P01597	117 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	TRBV12-3	P01733	135 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	IGKV1D-39	P04432	117 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	CLEC3B	P05452	202 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	FGF2	P09038	288 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	HOXB5	P09067	269 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	ZP3	P21754	424 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	ARL3	P36405	182 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	RND3	P61587	244 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	RAB32	Q13637	225 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF79	Q15937	498 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994		Q56UQ5	140 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM209B	Q5JX69	171 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	PLET1	Q6UQ28	207 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	RNF152	Q8N8N0	203 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	NECAP1	Q8NC96	275 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	OR1S1	Q8NH92	325 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	GPR146	Q96CH1	333 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	SEC22A	Q96IW7	307 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	PRR25	Q96S07	402 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	SRR	Q9GZT4	340 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF580	Q9UK33	172 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994		A0A0B4J293	547 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994		A0A1B0GW64	132 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	OR2T8	A6NH00	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	CGB1	A6NKQ9	187 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	C15orf61	A6NNL5	157 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	YIF1A	O95070	293 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	CDS2	O95674	445 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	IFNA10	P01566	189 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	IGKV1-5	P01602	117 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	IL7	P13232	177 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	CTRB1	P17538	263 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	GPR183	P32249	361 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	BLOC1S1	P78537	153 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	RUNX1	Q01196	453 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	WT1-AS	Q06250	92 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM187	Q14656	261 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	POU2AF1	Q16633	256 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	GUCA2B	Q16661	112 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-231	ENST00000554994	ACSM6	Q6P461	480 aa		3.55	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms