RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528252.5

SOX6-210, Transcript of SRY-box 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SOX6, Length 2,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6-210ENST00000528252 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.71□□□□□ -1.33
SOX6-210ENST00000528252 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
SOX6-210ENST00000528252 ZNF525Q8N782 197 aa6.71□□□□□ -1.33
SOX6-210ENST00000528252 DDB2Q92466 427 aa6.71□□□□□ -1.33
SOX6-210ENST00000528252 ZNF714Q96N38 554 aa6.71□□□□□ -1.33
SOX6-210ENST00000528252 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
SOX6-210ENST00000528252 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.71□□□□□ -1.33
SOX6-210ENST00000528252 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.71□□□□□ -1.33
SOX6-210ENST00000528252 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.71□□□□□ -1.33
SOX6-210ENST00000528252 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 TSPOP30536 169 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 ERVK-16P61578 105 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 HBG1P69891 147 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 HBG2P69892 147 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 TFF3Q07654 80 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 ATOH7Q8N100 152 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
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SOX6-210ENST00000528252 OR4C12Q96R67 309 aa6.71□□□□□ -1.34
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SOX6-210ENST00000528252 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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SOX6-210ENST00000528252 THBS3P49746 956 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 WDR73Q6P4I2 378 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 OR4A16Q8NH70 328 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 OR4S2Q8NH73 311 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 SMIM12Q96EX1 92 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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SOX6-210ENST00000528252 LY6HO94772 140 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 KIR2DS2P43631 304 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 OR4A47Q6IF82 309 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 PRR27Q6MZM9 219 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 TMEM140Q9NV12 185 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 CACNA1BQ00975 2339 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 PF4P02776 101 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 CT45A6P0DMU7 189 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 CT45A5P0DMU8 189 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 CT45A7P0DMV0 189 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 CBLN1P23435 193 aa6.7□□□□□ -1.34
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SOX6-210ENST00000528252 BAGE3Q86Y29 109 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 BAGE2Q86Y30 109 aa6.7□□□□□ -1.34
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SOX6-210ENST00000528252 RELBQ01201 579 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 OR4F5Q8NH21 305 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 UHRF2Q96PU4 802 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 OR4F4Q96R69 305 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.69□□□□□ -1.34
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SOX6-210ENST00000528252 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 OR2T8A6NH00 312 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 K7ERU9 68 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 NDUFS8O00217 210 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 IGKV1-16P04430 117 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 CRISP2P16562 243 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 REG1BP48304 166 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.69□□□□□ -1.34
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SOX6-210ENST00000528252 GNLYP22749 145 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 LHX4Q969G2 390 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 C15orf62A8K5M9 175 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 ESDP10768 282 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 PPOXP50336 477 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 DLX6P56179 175 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX6-210ENST00000528252 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
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