RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 LRTM2Q8N967 370 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 Q8NA96 180 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 NECAP1Q8NC96 275 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 KMT2EQ8IZD2 1858 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0G2JRQ6 117 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ZFP92A6NM28 416 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 J3QR89 54 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 DEFB125Q8N687 156 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 NEUROG1Q92886 237 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 MMP9P14780 707 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 AMTP48728 403 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 BLNKQ8WV28 456 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 PTH2Q96A98 100 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ERG28Q9UKR5 140 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 DIRC3C9JPN6 131 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 K7N7A8 449 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 LYNX1P0DP58 116 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 GATA3P23771 443 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 BTF3L4Q96K17 158 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 OR5B12Q96R08 314 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 CD33P20138 364 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 CDKN1AP38936 164 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 NMSQ5H8A3 153 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZRM9 215 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 GPR82Q96P67 336 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA25Q9BR10 227 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 GNG13Q9P2W3 67 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 PLXNB1O43157 2135 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 CD5LO43866 347 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 APOA2P02652 100 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ID3Q02535 119 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ATP5SQ99766 215 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 PARLQ9H300 379 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 B5MCH6 92 aa6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 ZG16O60844 167 aa6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 CCL3L1P16619 93 aa6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 IL15RAQ13261 267 aa6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 RTL8BQ17RB0 113 aa6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA1456Q9P272 454 aa6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 F8WDY8 70 aa6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV1-5P01602 117 aa6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 FAM78BQ5VT40 261 aa6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 RNF183Q96D59 192 aa6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 PITX3O75364 302 aa6.45□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF737O75373 536 aa6.45□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 DYSFO75923 2080 aa6.45□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 PLAUP00749 431 aa6.45□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 COX7A1P24310 79 aa6.45□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 PLGLAQ15195 96 aa6.45□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 HES4Q9HCC6 221 aa6.45□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.45□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.45□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.45□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.45□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00473A8K010 186 aa6.45□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM50AO95807 157 aa6.45□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 TYMSP04818 313 aa6.45□□□□□ -1.38
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