RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 ZNF546Q86UE3 836 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 ZNF429Q86V71 674 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 OR5B3Q8NH48 314 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 OR52E5Q8NH55 327 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 OR5R1Q8NH85 324 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 SSX3Q99909 188 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 NSG2Q9Y328 171 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 OR51B2Q9Y5P1 312 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 C15orf61A6NNL5 157 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 HMSDA8MTL9 139 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 MPTX1A8MV57 137 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 K7EPK0 472 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 SYNGR2O43760 224 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 CHST1O43916 411 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 SSSCA1O60232 199 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 PITX3O75364 302 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 DEDDO75618 318 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 P0C879 139 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 TAS2R30P59541 319 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 ERHP84090 104 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 TNFRSF9Q07011 255 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 EBI3Q14213 229 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 C9orf152Q5JTZ5 239 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 FAM120AOSQ5T036 256 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 PPP1R27Q86WC6 154 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 NPBQ8NG41 125 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 OR4D5Q8NGN0 318 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 SSMEM1Q8WWF3 244 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 DCUN1D4Q92564 292 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 HINT2Q9BX68 163 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 PLEKHA3Q9HB20 300 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 SIGLEC9Q9Y336 463 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 DOCK11Q5JSL3 2073 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 DSCAML1Q8TD84 2053 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 A0A0D9SG52 128 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 A0A0G2JRQ6 117 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 FGF16O43320 207 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 OR2F2O95006 317 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 IGKV2-30P06310 120 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 OR9G9P0C7N8 305 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 SNCAP37840 140 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 P2RY1P47900 373 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 CAV2P51636 162 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 OR2B8PP59922 312 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 RAB11AP62491 216 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 GNB1P62873 340 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 OR2F1Q13607 317 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 TNXAQ16473 311 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 PRSS8Q16651 343 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 C5orf64Q2M2E5 130 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 DEFB112Q30KQ8 113 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 STX12Q86Y82 276 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 DYNAPQ8N1N2 210 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 DTD1Q8TEA8 209 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 SMIM8Q96KF7 97 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 MFFQ9GZY8 342 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 MAGT1Q9H0U3 335 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 TMEM14BQ9NUH8 114 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 PSENENQ9NZ42 101 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 MBD2Q9UBB5 411 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 MOB4Q9Y3A3 225 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 WSB1Q9Y6I7 421 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 U3KQ87 197 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 RYR3Q15413 4870 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 SMLR1H3BR10 107 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 H3BUX3 64 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 TAAR5O14804 337 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 TSC22D2O75157 780 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 NDUFA3O95167 84 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 IFNA10P01566 189 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 IGLV2-23P01705 113 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 VPREB1P12018 145 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 CD24P25063 80 aa5.74□□□□□ -1.49
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