RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		12.56	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	PALMD	Q9NP74	551 aa		12.56	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		12.56	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		12.56	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	OR2T8	A6NH00	312 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148		A8MWP6	167 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	MT-CO2	P00403	227 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	TCRB	P04435	133 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	CSN3	P07498	182 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	12.55	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	ASAH1	Q13510	395 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	HAGH	Q16775	308 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	TXN2	Q99757	166 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	NUDT15	Q9NV35	164 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148		F8W735	103 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	MFAP4	P55083	255 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	RETN	Q9HD89	108 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	12.54	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		12.53	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		12.53	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	PITX3	O75364	302 aa		12.53	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	HOXB5	P09067	269 aa		12.53	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	OPRK1	P41145	380 aa		12.53	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	C2orf83	Q53S99	150 aa		12.53	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	NOXA1	Q86UR1	476 aa		12.53	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	DTD1	Q8TEA8	209 aa		12.53	□□□□□ -0.4
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF320	A2RRD8	509 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	C2orf70	A6NJV1	201 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	GNG7	O60262	68 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	EDN2	P20800	178 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	NPY1R	P25929	384 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	ENKUR	Q8TC29	256 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	SPATA25	Q9BR10	227 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	RBKS	Q9H477	322 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	NDUFA4	O00483	81 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	MED6	O75586	246 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	IFNA21	P01568	189 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	NPBWR1	P48145	328 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	LCN12	Q6JVE5	192 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	MITD1	Q8WV92	249 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148		U3KQ87	197 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM213	A2RRL7	107 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	SCGB2A1	O75556	95 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	ADAP1	O75689	374 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	IFNA10	P01566	189 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV3-48	P01763	117 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	FOLR2	P14207	255 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	ADM	P35318	185 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	CTSG	P08311	255 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	DEFA1	P59665	94 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	DEFA3	P59666	94 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	MARC2	Q969Z3	335 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	SLC25A4	P12235	298 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	CBLN1	P23435	193 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	IFITM3	Q01628	133 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	OR4X1	Q8NH49	305 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	C15orf62	A8K5M9	175 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF785	A8K8V0	405 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	MPTX1	A8MV57	137 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	SYNGR2	O43760	224 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	CLN5	O75503	358 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MIB2-223	ENST00000508148	CD7	P09564	240 aa		12.47	□□□□□ -0.41

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