RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 FAM90A13PP0C7W8 464 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 FAM90A24PP0C7X0 464 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 HLA-DOBP13765 273 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 NXPH1P58417 271 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 GNB1P62873 340 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 CEND1Q8N111 149 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 SMRP1Q8NCR6 262 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 NMNAT3Q96T66 252 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 LY96Q9Y6Y9 160 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 A8MWV9 139 aa5.05□□□□□ -1.6
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PDE4D-216ENST00000507116 NUDT14O95848 222 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 CRYGAP11844 174 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 CLDN2P57739 230 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 PSMG4Q5JS54 123 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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PDE4D-216ENST00000507116 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 ALKBH4Q9NXW9 302 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 OBSL1O75147 1896 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 HCFC1P51610 2035 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 DOCK11Q5JSL3 2073 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 EXPH5Q8NEV8 1989 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.05□□□□□ -1.6
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PDE4D-216ENST00000507116 ABCA11PQ4W5N1 156 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 MS4A13Q5J8X5 152 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 Q6ZSR3 168 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 SIT1Q9Y3P8 196 aa5.05□□□□□ -1.6
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PDE4D-216ENST00000507116 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 NUP98P52948 1817 aa5.04□□□□□ -1.6
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PDE4D-216ENST00000507116 LINC01620Q4KN68 170 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 OXLD1Q5BKU9 147 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 TIMM9Q9Y5J7 89 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 SHISA9B4DS77 424 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM178BH3BS89 294 aa5.04□□□□□ -1.6
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PDE4D-216ENST00000507116 COL4A5P29400 1685 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF831Q5JPB2 1677 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 FAM90A7PA6NKC0 464 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 FAM90A22PA8MWA6 464 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 FAM90A12PA8MX19 464 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 CD7P09564 240 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 FOXC1Q12948 553 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 V9GYV3 84 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa5.03□□□□□ -1.6
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PDE4D-216ENST00000507116 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.03□□□□□ -1.6
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PDE4D-216ENST00000507116 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
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PDE4D-216ENST00000507116 TAS2R4Q9NYW5 299 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 TAAR2Q9P1P5 351 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 A0A1B0GVT2 93 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 PRR32B1ATL7 298 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 NDUFC2O95298 119 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-216ENST00000507116 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
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