RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 IL3RAP26951 378 aa7.13□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 S100A2P29034 98 aa7.13□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 KLRD1Q13241 179 aa7.13□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 SLC35E1Q96K37 410 aa7.13□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 UHRF2Q96PU4 802 aa7.13□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 PFDN5Q99471 154 aa7.13□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.13□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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CDHR3-211ENST00000478080 F6UZH7 168 aa7.12□□□□□ -1.27
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CDHR3-211ENST00000478080 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.12□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 OCC1Q8TAD7 63 aa7.12□□□□□ -1.27
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CDHR3-211ENST00000478080 FBXL15Q9H469 300 aa7.12□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 CBLN4Q9NTU7 201 aa7.12□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 MED13LQ71F56 2210 aa7.12□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.12□□□□□ -1.27
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CDHR3-211ENST00000478080 CDKN1AP38936 164 aa7.12□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 LGALS7P47929 136 aa7.12□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 FBLN7Q53RD9 439 aa7.12□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.12□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 RPEQ96AT9 228 aa7.12□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 OR5B12Q96R08 314 aa7.12□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.12□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.12□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 A0A0U1RQK1 487 aa7.11□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.11□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 MOSP00540 346 aa7.11□□□□□ -1.27
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CDHR3-211ENST00000478080 FABP4P15090 132 aa7.11□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 CRYBB3P26998 211 aa7.11□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 OR4X1Q8NH49 305 aa7.11□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.11□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.11□□□□□ -1.27
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CDHR3-211ENST00000478080 PSMB11A5LHX3 300 aa7.11□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 K7EN84 100 aa7.11□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 LIPFP07098 398 aa7.11□□□□□ -1.27
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CDHR3-211ENST00000478080 PYYP10082 97 aa7.11□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
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CDHR3-211ENST00000478080 TEX45Q8NA69 505 aa7.11□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 BEND2Q8NDZ0 799 aa7.11□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 TNFRSF14Q92956 283 aa7.11□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.11□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.11□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.11□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 PRO1933Q9H354 126 aa7.11□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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CDHR3-211ENST00000478080 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
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CDHR3-211ENST00000478080 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.1□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.1□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 SFRP2Q96HF1 295 aa7.1□□□□□ -1.27
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CDHR3-211ENST00000478080 SLC17A3O00476 420 aa7.1□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 PPP1R2P9O14990 202 aa7.1□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
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CDHR3-211ENST00000478080 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.1□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.1□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.1□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.1□□□□□ -1.27
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CDHR3-211ENST00000478080 VPS13CQ709C8 3753 aa7.09□□□□□ -1.27
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CDHR3-211ENST00000478080 PPP5D1E7EU14 171 aa7.09□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.09□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 C8orf88P0DMB2 117 aa7.09□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
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CDHR3-211ENST00000478080 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.09□□□□□ -1.27
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CDHR3-211ENST00000478080 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 PRORYQ9H606 182 aa7.09□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.09□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 LOC105371242A0A075B767 164 aa7.09□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 TEX22C9J3V5 150 aa7.09□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 C19orf84I3L1E1 186 aa7.09□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 COX7A2P2O60397 106 aa7.09□□□□□ -1.27
CDHR3-211ENST00000478080 FSTL3O95633 263 aa7.09□□□□□ -1.27
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