RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF329Q86UD4 541 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C1QL4Q86Z23 238 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C3orf56Q8N813 242 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CXorf58Q96LI9 332 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TGOLN2O43493 480 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADAP1O75689 374 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IFNA21P01568 189 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HOXB5P09067 269 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR2F1Q13607 317 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HAGHQ16775 308 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ARL6Q9H0F7 186 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COL6A5A8TX70 2615 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CIDEAO60543 219 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 APELAP0DMC3 54 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DDTP30046 118 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAB9AP51151 201 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BLOC1S1P78537 153 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TNFRSF9Q07011 255 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR2C3Q8N628 320 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF114Q8NC26 417 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR5T1Q8NG75 326 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C14orf144Q96I85 54 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HINT2Q9BX68 163 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KLK15Q9H2R5 256 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A1B0GV90 55 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRGV3P03979 118 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR13C7P0DN81 318 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PF4V1P10720 104 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CXCL2P19875 107 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CXCL3P19876 107 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ID3Q02535 119 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BSXQ3C1V8 233 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NECAP1Q8NC96 275 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR1P1Q8NH06 330 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 STOML3Q8TAV4 291 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 USMG5Q96IX5 58 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR10C1Q96KK4 312 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GGACTQ9BVM4 153 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A0G2JLM5 398 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM223BA6NKX1 122 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CYB5BO43169 146 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MED6O75586 246 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LY86O95711 162 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRH1P02810 166 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 REG1AP05451 166 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DEFA4P12838 97 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HOXA5P20719 270 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TPPP2P59282 170 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DLK1P80370 383 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RHOGP84095 191 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RUNX1Q01196 453 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IL15RAQ13261 267 aa6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.7 ms