RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 HEPN1Q6WQI6 88 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ZNF439Q8NDP4 499 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 OR10G4Q8NGN3 311 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 C8orf46Q8TAG6 207 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 LEAP2Q969E1 77 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 OR2A7Q96R45 310 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 AGMATQ9BSE5 352 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 C19orf24Q9BVV8 132 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ROS1P08922 2347 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 CGB1A6NKQ9 187 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 PPIAL4GP0DN37 164 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 SNCAP37840 140 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 GNB2P62879 340 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 LIAT1Q6ZQX7 453 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 C5orf17Q8NAS9 161 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 Q8WTZ3 238 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ABHD14BQ96IU4 210 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TMEM222Q9H0R3 208 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
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CCR6-201ENST00000341935 C17orf98A8MV24 154 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 HSBP1O75506 76 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TRGC1P0CF51 173 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 PAX1P15863 534 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 CNN1P51911 297 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 HSD52Q0P140 79 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 FA2HQ7L5A8 372 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 LRTM2Q8N967 370 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 C18orf12Q96KH6 178 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 COL12A1Q99715 3063 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TENM4Q6N022 2769 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 G3V4G9 280 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 GNG5P63218 68 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 CT45A1Q5HYN5 189 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 LY6G5BQ8NDX9 201 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 OR1B1Q8NGR6 318 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 OR5B3Q8NH48 314 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 OR51H1Q8NH63 302 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 CT45A3Q8NHU0 189 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 GATAD1Q8WUU5 269 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 BPESC1Q9GZL8 116 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 IFI27L2Q9H2X8 130 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 SRD5A3Q9H8P0 318 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 OR5AC2Q9NZP5 309 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 WSB1Q9Y6I7 421 aa4.94□□□□□ -1.62
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CCR6-201ENST00000341935 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 IL22RA2Q969J5 263 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 GINS3Q9BRX5 216 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TUBA4BQ9H853 241 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 SERTAD4Q9NUC0 356 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 CHD6Q8TD26 2715 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 RS1O15537 224 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 IGHV1-8P0DP01 117 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TCTAP57738 103 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ODF3L1Q8IXM7 274 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 FAM168AQ92567 244 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 SEC22AQ96IW7 307 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 SGK494Q96LW2 274 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 MS4A10Q96PG2 267 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 HMSDA8MTL9 139 aa4.93□□□□□ -1.62
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CCR6-201ENST00000341935 G3V3Q6 166 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 RBP4P02753 201 aa4.93□□□□□ -1.62
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CCR6-201ENST00000341935 ZNF585BQ52M93 769 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 RPL39P5Q59GN2 51 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ZNF66Q6ZN08 573 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 LYZL2Q7Z4W2 148 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ZNF695Q8IW36 515 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 CLDND2Q8NHS1 167 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 C10orf105Q8TEF2 133 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 OR10C1Q96KK4 312 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 NDFIP1Q9BT67 221 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 MYO18BQ8IUG5 2567 aa4.93□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ABCA4P78363 2273 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa4.92□□□□□ -1.62
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